تشريح الشواء المصلي متعدد العوامل مساهمة استجابات فيروسات كورونا البشرية الموجودة مسبقًا في مناعة -2 السارس (الجزء 2)

لمعرفة المزيد من المعلومات الرجاء الاتصالdavid.wan@wecistanche.com

القرار من زمني جسم مضاد ديناميات بواسطة أبكورا سر-أوبروfiلينغ.  تعبر-مقطعيةالتحليلات من تفاعل الجسم المضاد بعد السارس -2التشخيص بواسطة RT-Pسجل تجاري (N = 369) وبعد البداية منأعراض (N = 333) تحتها خط ال الاهلية من أبكورا سر- أوبروfiling لتشريح بداية ، وذروة ، وتلاشي فيروس SARS-CoV -2 جسم مضاد استجابات (تين. 5a, ب ، الشكل التكميلي 11). في الأفراد مع a معروف تاريخ من fiأول SARS-CoV -2 تشخيص RT-PCR أو ظهور الأعراض ، يكتشف ABCORA 2.3إد مبكر مصلي-سيون في 98 في المائة (48من 49) و100 بالمائة (9من 9) من فرادى داخل7 أيام ما بعد RT-PCR وظهور الأعراض على التوالي. بجانب IgM و تفاعل IgA ، كانت استجابات IgG قابلة للاكتشاف بسهولة في ABCORA 2. 0 بعد أيام قليلة من الإصابة (Supplemeنتاريتين. 11a).

التقييم الطولي لفوجمن التماثل للشفاء المرضى فوقإلى  11  أشهر بعد الإصابة (251 قياسًا على 120 المرضى)  أبرزتالزمنيدينامياتمن SARS-CoV -2 الأجسام المضادة ملزمة. قدرنا الانحلال of ربط التفاعلية توظيف aقوة القانون نموذج مختلط وحدد دلالة reduction في RBD, S1, و N في الكل إيغ الأنواع الفرعية (تين. 5b) معنصف عمر المدى من 67 إلى 404 يومًا ، مع تحلل عيار IgG N لملف أسرع ،فيخطمعالسابق   التقارير10.   نصف-الأرواحمنال محايدiزيشن ذو صلة مفتش استجابات إلى RBD و S1 كانوا 125 و 404 يومًا على التوالي. ومن المثير للاهتمام أن حركية المعادلة الأجسام المضادة فعلت ليس مرآة ال تسوس معدلات لوحظ للربط الأجسام المضادة. انخفض نشاط التحييد أكثر منليرة لبنانية في a أبطأمعدل, مع a نصف-حياة 991 يومًا (الشكل.5ج). كان هذا جزئيًا بسبب أمختلطالتفاعليةنمطمعبعضفرادىعرضازيادة في تحييد نشاط بريد إيجابي السارس-CoV-2 ر. PCR5، في حين أن نشاط التحييد في الآخرين يتحلل بسرعة (تكميلي الشكل 11 ج).

تأثيرات من HCV حصانة على السارس-CoV-2 استحواذ. إلى

تمكن من التحقيق في الترابط بين الوجود السابقng إموحدة إلى HCoV و السارس-CoV-2 عدوى, نحن موسع الأبكورا حبة مولد المضاد مجموعة مصفوفة إلى تضمن S1 البروتينات من الكل أربعة المتداولة  HCoVs  (HCV-NL63,  HCV-229E ، HCV-HKU1 ،HCV-OC43) (Suمكمل تين. 12a). حسبما إلى انهاالاهلية إلى مراقب الأجسام المضادة إلى fiهاء فيروسات كورونا، نحن يطلق عليه الفحص أبكورا 5.0 و تم تدريبه و التحقق من صحتها هو - هي على ال نفسالأفواج كما أبكورا 2.0 (تين. 1). للسماح بإجراء مقارنة مباشرة مع أبكورا 2.0 والاستعمال لنماذج التنبؤ بالتعادل ، نحنتستخدم ال عتبة-/إعدادات التحليل المستندة إلى SOC لـ ABCORA 2. 0 ايضا إلى عن على أبكورا 5.0. على أساس على أبكورا 5. 0 قياسات تمرين الأفواج I–ثالثا, نحن ابتكر اثنين عشوائي غابة-التحليل القائم عارضات ازياء. أنكورا 5.4 متضمن بمفردي ال 12 السارس-CoV -2 المعلمات ، وتشمل ABCORA 5.5d فيإضافة ال  S1  HCoV قياسات مضيفا ما يصل إلى 24 معلمة في المجموع. قياسا علىأبكورا 2.3, التأسيس من HCV التفاعلية داخل ال نموذجكنت مفيد. أنكورا 5.5 قدم أعلى حساسية ومحددfiمدينة بين ال التحليلات الخوارزميات سبر أبكورا 5.0 (تكميلي الشكل 12 ب ، الجدول التكميلي 10).

الترابط بينجسم مضاد  التفاعلية  إلى  ال  أربعة HCoVs و SARS-CoV-2 معكوسة ماذا او ما نحن سابقًا لاحظ

إلى عن على HKU1 مع a خصوصا عالي علاقه مترابطه من IgM التفاعلية من

السارس-CoV-2 و HCoVs في قبل-جائحة الأفراد ، على وجه الخصوص فيأولئكمعمؤخرًا  HCV  عدوى  (تكميليالشكل 13). عدوى HCV متكررة ولكنها تخضع لموسميةوالانتشار من فرد HCV الالتهابات يتأرجح41,42. في النسق مع هذا ، تم قياس انتشار استجابات HCV بواسطة ABCORA 5.0 في محلي الدم المتبرعين في يناير 2019 (N = 285), مايو  2019   (N=288) ، وكانون الثاني (يناير) 2020 (N=252) تباينتإلى حد كبير  (تين. 6). إلى يُمكَِن a زمن-خاضع للسيطرة مقارنة HCV التفاعلية ما بين السارس-CoV-2-مُصاب و المتبرعين الأصحاء, نحن فحص الدم المتبرعين من مايو 2020  (N = 672), متى السارس-CoV-2 انتشار كنت يقدر بأقل من 2 في المائة في زيورخ ، سويسرا43, بواسطة أبكورا 2.{{0}} / 5.0 واستبعدت جميع العينات مع السارس-CoV-2 التفاعلية. ال المتبقية مايو 2020المجموعة النموذجية (N=653)شكلت a جائحة, صحي جهات مانحة مراقبة مجموعة. ومن المثير للاهتمام،تختلف أنماط تفاعل HCV في 2019 و 2020ered جوهريا كما تقييم بواسطة واحد-طريق أنوفا, مع عرض يناير 2020نسبيا أدنى و مايو 2020 ال الأعلى إيغا و مفتشرد فعلمدينة, أيّ مايو تشير a في وقت لاحق بداية من ا HCV وبائي في عام 2020 مقارنة بعام 2019 (اختبارات t لشهر مايو 2020 مقابل اختبارات أخرى مجموعات قهاون في تين. 6).

الأمر الأكثر إثارة للاهتمام هو أن تحليل كومالتقشير مايو2020 متبرعون أصحاء مصابون بفيروس SARS-CoV -2-lإدفيبريل, مايو، و يونيه 2020 (N = 65) مكشوف دلالةfiبوقاحة أدنىHCV التفاعلية في السارس-CoV-2 إيجابي المرضى (تين. 7a). هذه نمط كنت ايضا واضح متى نحن مدد التحليل ليشمل الممتلئالفوجمن السارس-CoV-2  الأفراد المصابين قياسمع  أبكورا  5.0 (N=389 ، أخذ عينات من آذار (مارس) 2020 إلىشهر فبراير  2021,  تكميلي  تين. 14). بشكل عام ، هذه النتائج فيdمثلج الذي - التي قبل-موجود منيع استجابات إلى HCoVs مايو إلى a حماية بدرجة معينة من الإصابة بفيروس SARS-CoV -2iعلى.

انقر هنا لمعرفة المزيد عن Cistanche

تين. 5 يراقب زمني تطور من جسم مضاد استجابات. ا أبكورا 2.3 تعريف من الإيجابية المصلية في المتبرعين مع إيجابي RT-PCR تم تأكيد السارس- عدوى -2 CoV وتاريخ RT-PCR المعروف (N = 369). الإيجابية المصلية تقييمحول بلازما أخذ العينات زمن نقطةبعد التشخيص هو يصور. رمادي منطقة مظللة يسلط الضوء ال أول سبعة أيام حيث إيجابي RT-PCR كشف. bقوة القانون نموذج, مع زمن حيث RT-PCR كما مُثَبَّت تأثير والفرد كتأثير عشوائي, تقدير ال تسوس من نشاط ربط الجسم المضاد على أساس ABCORA 2. 0 القياسات في 1-4 نقاط زمنية طولية في 120 فردًا بإجمالي251 قيسnts. أرجواني خطوط تطابق إلى ال عارضات ازياء تقدير ومظلل بنفسجي المناطق إلى ال95 بالمائةالثقة فترات. الجسم المضاد نصف-الأرواح (t1/2 في الايام) من هام عارضات ازياء نكون يصور. الدلالة كنت تقييم استخدام ساترثويت تقريب إلى عن على a اثنين-جانب t-اختبار على ال ميل المعلمات. ج- قانون السلطة نموذج, مع زمن حيث RT-PCR كما مُثَبَّت تأثير و فرد كما a عشوائي تأثير, تقدير ال تسوس من تحييد الاهلية على 251قياسات من 120 فرادى. فقط فرادى مع NT50> 100في هُم أول قياس كانوا تستخدم إلى تقدير ال نصف-الحياة. ال ليلكي يتوافق الخط إلى ال نموذج تقدير و ال ليلكي مظلل منطقة إلى ال95 بالمائةالثقة فترات. الدلالة كنت تقييم استخدام تقريب ساترثويت إلى عن على a اثنين-جانب t-اختبار على ال ميل المعلمات.

تين. 6 موسمي و سنوي flتذبذب في HCV التفاعلية. التفاعلية إلى بشري فيروسات كورونا (HCV-NL63, HCV-229E, HCV-HKU1, HCV-OC43)كنت مقارنة بواسطة أبكورا 5.0. التفاعلية في صحي الدم المتبرعين من 2019 و 2020 كنت مقارنة. قبل-جائحة عينات متضمن: يناير 2019 (N = 285), مايو 2019 (N = 288), يناير 2020 (N = 252). عينات من مايو 2020 (N = 672) كانوا جمعت أثناء ال جائحة في سويسرا. عينات فقط بدون السارس-CoV-2 محدد التفاعلية كما مُعرف بواسطة أبكورا كانوا متضمن (N = 653). النجوم تطابق إلى المستويات من الدلالة من اثنين-من جانب تي-الاختبارات المقارنة ال مبين مجموعات. المستويات من الدلالة نكون تصحيح بواسطة ال بونفيروني طريقة إلى عن على مضاعف اختبارات و مبين كما يتبع:        *p<0. 05/36، **p < 0.01/36,="">p<0. 001/36.بوكسبلوتس يمثل ال التالية: الوسيط مع ال وسط خط, العلوي و أدنى الرباعيات مع ال علبة حدود, 1.5x بين ربعي نطاقات مع ال شعر اللحية، و القيم المتطرفة مع نقاط.

تأثيرات من  HCV  حصانة في  السارس-CoV-2  عدوى.  إلى

استكشاف الترابط مع مناعة HCV كذلك ، نحن nextالتحقيق سواء HCV استجابات نكون مرتبط للتطورمن السارس-CoV-2 الأجسام المضادة. إلى هذه النهاية ، قمنا بتحليل الأجسام المضادةاستجابات في البلازما لـ 204 أفراد تم أخذ عينات منهمفي 60 عدد الأيام بعد SARS-CoV -2التشخيص باستخدام نموذج الانحدار الخطي تم تعديلها حسب العمر والجنس والوقت منذ ظهور RT-PCR الإيجابي و HCVالتفاعلية. إلى طبقية HCoV التفاعلية داخل عالي و قليل نشاط HCoV, الوسيطسجل MFI-عدو كانوا ديfiنيد إلى عن على كل HCV وجسم مضادصف دراسي. LogMFI-FOE أعلى من المقابلالوسيط لـ at least ثلاثة HCoVs (HKU1, OC43, NL63, أو 229E) في نوع معينc إيغ صف دراسي كانوا مرتبة كما نأخذ عالي HCV نشاطضمن هذه الفئة. أولاً ، فقط التفاعلات بين نفس العداءbاوديفئة وe استكشافها في ال نموذج (i.e., HCV مفتش عالي على السارس- CoV -2 IgG). لاحظنا الاستثناءليقويالتبعيات إلى عن على إيغا و IgM استجابات إلى SARS-CoV -2 ، والتيالكلكانوادلالةfiبوقاحةأعلىفيفرادىمععالي HCVالتفاعلية (تين. 7b). هذه يقترح بشدة أن HCV الموجود مسبقًا قد توفر الحصانةe ا مميزات في تصاعد السارس-CoV-2 استجابات.الترابط بين HCV IgG و SARS- CoV-2  لوحظ IgG محدد فقط من أجل استجابة S2. ومن المثير للاهتمام أن دعم هذه النتيجة هو HCV S2 hأيلبر استجاباتكانوا حديثاً وجدت إلى تعزيز السارس-CoV-2 حصانة, فيخاص نشاط الجسم المضاد S231. لاستكشاف ما إذا كان SARS-CoV -2 IgGيبني على مؤخرًا HCV إيغا و IgM استجابات نحن التالي سبرما إذا كان HCV IgM و IgA مرتبطين بـ eleمغرم السارس-CoV-2 محددfic  مفتشالمستويات.بينما لم يكن هناك تأثير واضح على IgM ، إلا أننا لاحظ علامةifiغير قادر جمعية من عالي HCV إيغا نشاط علىالكلأربعةتقاس  السارس-CoV-2  استجابات  (تين.  7c,  d). هذه يقترح بشدةالذي - التيمؤخرًا  HCV  عدوى لديهاa بنficial تأثير على تركيب استجابة الجسم المضاد لـ SARS-CoV -2ses.

في ال التالي التحليلات, نحن سبر إذا قبل-موجود HCV حصانةلديها ا تأثير على شدة المرض في COVID - 19. تحقيقا لهذه الغاية ، نحنسبر HCoV حصانة في 80 في المستشفى وغير داخل المستشفىفرادى مُصاب إلى عن على أقل من 30 يومًا (الشكل.8أ). السيطرة على العمر والجنس ، وجدنا أن الأفراد مع مرحباgh قبل-موجود تفاعل HCV كان له دلالةضدأدنى  دسإلىيتطلبالعلاج في المستشفيات  (جماركتراجع  أو = 0.16 ، 95 بالمائة CI (0. 04 ، 0 67) ، الشكل.8ب ، الشكل التكميلي 15). طبقة أخرىifiالكاتيون منpatients بواسطة سواء أنهم مطلوب علاج او معاملة في ا وحدة العناية المركزة أظهر a خفضت احتمالية أن المريضts مع عالي HCoV استجابة المعدلات المطلوبة العلاج في المستشفيات مع كثيف رعاية (ترتيبي تراجعأو {{0}}. 36 ، 95 بالمائة CI (0. 13، 0.96) ، الشكل.8ب ، التكميليةFig. 15). هكذا, فرادى مع عالي HCoV المستويات كان a 64 في المئة خفضت احتمالات تتطلب دخول المستشفى وفقًا لـ أودينال مرتبة تحليل الانحدار المقارنة في المستشفى في عادي عنابر, في العناية المركزة ، وغير مستشفياتd فرادى   (تين.  8a,  b).   جماعي,  هؤلاء تشير الملاحظات بقوة إلى تأثير وقائي متقاطعof HCVمناعة في تشكيل الدفاع المناعي ضد السارس-CoV-2.

تين. 7 تأثيرات من قبل-موجود HCV حصانة أثناء السارس-CoV-2 استحواذ. a زمن-متطابقة مقارنة من أبكورا 5.0 التفاعلية إلى عن على السارس-CoV-2و HCoVs في صحي و السارس-CoV-2 مُصاب فرادى. صحي المتبرعين كانوا أخذ عينات في مايو 2020 (N = 653; أزرق). بلازما من السارس-CoV-2     فرد مصابs كنت جمعت ما بين أبريل–يونيه 2020 (N = 65; أحمر). نرى تكميلي تين. 14 إلى عن علىاالتحليلات من ال ممتلئ السارس-CoV-2 إيجابي الفوج(N = 389). رمادي مربعات تشير القيم في الاعلى ال فرد MFI-عدو يقطع-قبالة إلى عن على السارس-CoV-2 محدد استجابات إلى عن على كل مولد المضاد. النجوم تطابق إلى المستويات من الدلالة من اثنين-جانب t-الاختبارات المقارنة نفي عكس إيجابي المرضى. المستويات من الدلالة نكون تصحيح بواسطة ال بونفيروني طريقة لعدة اختبارات و مبين كما يتبع: *p<0. 05/12، **p<0. 01/12 ، ***p<0. 001/12 (مفتش HKU1: p = 0.66, مفتش OC43: p = 0.45 ، IgG NL63: p=3.3 × 10−04، مفتش 229E: p = 1.6 × 10−05، IgA HKU1: p=1. 8 × 10−03، IgA OC43: p=1. 3 × 10−05، IgA NL63: ف=1. 4 × 10−07، IgA 229E: p=3. 0 × 10−05، IgM HKU1: ص = 3.3 × 10−08, IgM OC43: p = 4.3 × 10−03, IgM NL63: p = 1.1 × 10−07, IgM 229E: p = 2.7 × 10−02). بوكسبلوتس يمثل ال التالية: الوسيط مع الوسط خط, العلوي و أدنى الرباعيات مع ال علبة حدود, 1.5x بين ربعي نطاقات مع ال شعر اللحية، و القيم المتطرفة مع نقاط. b خطي تراجع تظهر النماذج ال جمعية ما بين السارس-CoV-2 و HCV إشارات في 204 السارس-CoV-2 إيجابي المرضى مع معروف تواريخ من أولا إيجابي RT-كشف PCR. تأثيرات داخل ال نفس جسم مضاد صف دراسي نكون التحقيق. ال عارضات ازياء كانوا معدلة على سن (خدد مع 3 درجات من الحريه), جنس, الوقت منذ ذلك الحين إيجابي RT-PCR (خدد مع 3 درجات من الحريه), و مستوى من HCoV التفاعلية. عينات نكون مصمم إلى مرفأ عالي HCV التفاعلية إذا أنهم عرض ABCORA 5.0 HCVسجل MFI-عدو القيم أعلى من ال المقابلة الوسيط في في الأقل 3 HCoV قياسات (HKU1, OC43, NL63, أو 229E). المنحنيات تتوافق إلى ال عارضات ازياء تقدير و مظلل المناطق إلى ال95 بالمائةالثقة فترات. p-القيم كانوا تم الحصول عليها بواسطة ادارة a اثنين-جانب طالب علم t-اختبار على ال معامل مرتبطة مع HCV التفاعلية في ال خطي تراجع. c خطي تراجع نموذج عرض ال جمعية ما بين السارس-CoV-2 مفتش و HCV إيغا إشارات. منحنيات تطابق إلى ال عارضات ازياء تقدير و مظلل المناطق إلى ال95 بالمائةالثقة فترات. p-القيم كانوا تم الحصول عليها بواسطة ادارة اثنان-جانب طالب علم t-اختبار على ال معامل مرتبطة مع HCV التفاعلية في ال خطي تراجع. d خطي تراجع نموذج عرض ال جمعيةبين SARS-CoV -2 إشارات IgG و HCV IgM. تتوافق المنحنيات مع تقدير النموذج والمناطق المظللة مع فواصل الثقة 95 بالمائة. ف القيمةكانت تم الحصول عليها بواسطة ادارة a اثنين-جانب طالب علم t-اختبار على ال معامل مرتبطة مع HCV التفاعلية في ال خطي تراجع.

تناقشأيون

ديfinition من  السارس-CoV-2  حصانة بعد التطعيم والعدوى ذات أهمية فورية44–46. فك رموز مكافحةهيئةيرتبطمن السارس-CoV-2  الحمايةويراقب مصل الاستجابة هي مهام صعبة في المستقبل. الحجم أو طول العمر من محمي جسم مضاد استجابات إلى طبيعي العدوى و مختلف اللقاحات بحاجة إلى إلى يكون فحص إلى تفهمالمعلمات الذي - التي شكل محمي الاستجابات وتوجيه القرارات على إعادة التطعيم في غير المستجيبين والتحصين ضدnشارعرواية الناشئة السارس-متغيرات CoV -247. وبالمثل ، خلق الوسائل ل يميز مصليا بين عدوى دي نوفو ، إعادةعدوى,و مصل استجابات, هُم متانة و الفشل إرادة يبقىسجل تجاريمائل إلى عن على مرضي تشخبص.

هنا نحن يتظاهر ال عالي خدمة من متعدد-معامل سر- التأمل في معالجة القضايا الرئيسية في دefiنينغ  السارس-CoV-2 حصانة.  متزامنةكشفمن استجابات الجسم المضاد لـ نطاقمن السارس-CoV-2  المستضداتومختلف  إيغالطبقاتمع أبكورا  سيروبروfiلينغقدم صورة شاملة عن الحالة المصلية لـ SARS-CoV -2 في فحص واحد ، والتي كاليفورنياn تكون مفيدة للتشخيص السريري لتحديد الوجود الإلكترونيoو عودة العدوى,  ديfiشمال شرقعودة العدوى,  وردإلىتلقيح. حسابيالنمذجةايضامسموحتنبؤ النيو البلازماادراك الاهلية من أبكورا النتائج, التمكين aشاملة تقييم من السارس-CoV-2 جسم مضاد ديناميات ولهم تتفاعل معHCV استجابات. نحن درس اثنين أبكورا فحصإصدارات الفي على حد سواء تقاس HCV التفاعلية جنبا إلى جنب ال  12 السارس-CoV-2 المعلمات.تضمن ANCORA 2 مستضد S1 لـHKU1. أنكورا 5 متضمن S1 من الكل أربعة تعميم HCV.بشكل ملحوظ, حسابي عارضات ازياء الذي - التي متضمن ال HCVقياسات مسموح a أعلى الاحكام في تحديد السارس-CoV- 2 ـ إيجابية مصلية عاليةإضاءة الترابط ما بين HCoVو السارس-استجابات CoV {0}} التي يجب حلها.

تسجيل التفاعلية ضد الكل أربعة HCoVs في السارس-CoV-2غير مصاب ومُصابفرادىنحنلاحظمثيرة للاهتمامذات الصلة. يوغير مصابفرادىعرضأعلى  HCVرد الفعل مقارنة مع الأفراد المصابين يقترحaإسهام من HCV حصانة إلى مبكر دفاع ضد السارس-CoV- 2. قد يكون لمناعة التهاب الكبد سي تأثيرات إيجابية على فيروس السارس -2عدوى. في اتفاق مع آخر التقارير, نحن وأشار aعبر التغذية من السارس-CoV-2 والاستجابات HCV في عدوى SARS-CoV -231,48 مع فرادى مع عالي HCV التفاعلية تطوير-الافتتاح أعلى السارس-CoV-2 جسم مضاد المستويات. معظم بشكل ملحوظ، موجود مسبقًا HCV حصانة كان ا تأثير على مرض خطورة في منطقتنا الفوج. السارس-CoV-2 مُصاب فرادى مع قليل تفاعل HCV كان a أعلى احتمالية من تتطلب العلاج في المستشفيات.

في حينملكنادراسةاستجابات الأجسام المضادة المقاسة فقط ، أالقدرهمحميتأثيرمن HCoVحصانة ضد السارس-CoV-2 استحواذ ينبغي ليس يكون ينظركمامقيد إلى نشاط الجسم المضاد. الأجسام المضادة والمناعة الخلوية قد تكون ذات صلةونشط في الحفل31,49–51. بدلا من ذلك ، يستجيب الجسم المضادsإسmخفف في ال الحالي دراسة مايو بمفردي وثيقة مؤخرًا HCV العدوىn و ايصال a بديل قياس من آخر محميHCV استجابات. ال حلقة الوصل ما بين أعلى HCV  و السارس-CoV-2 التفاعلية في الأفراد المصابين أمر مثير للاهتمام بشكل خاص. الأقوى تأثيرات كانوا رأيت إلى عن على IgM و إيغا HCoV استجابات, سوgيشير الذي - التي مؤخرًا HCV حصانة يوفر ا مبكر تعزيز إلى يتطور الجسم المضاد لـ SARS-CoV -2الأنف والحنجرة.  سواءهذههوبسببإلى استجابات الخلايا البائية المتقاطعة على أيال  السارس-CoV-2حصانة يبني على و ينضج أو سواء الاعتراض-رد الفعل T المساعدأنشطةلعبدور مهيمن كما هو مقترح31  سوف يكون مهم إلى حل في إيابا-آت دراسات. ال الدور الدقيق و الوقتg من HCoVاستجاباتالتأثير  السارس-CoV-2  جسم مضاداستجابات ايضا يبقى إلى يكون ديfiنيد. مبكر قليل-affiنيتي استجابات HCoV مايو لديك a إيجابي تأثير على ال تطوير السارس-CoV-2 ـ المناعة عن طريق تكوين ذاكرة مناعية على أساسها إلى يبني, بينما امبليfiالكاتيون من عدم-محميعبر رد الفعلHCV والأضلاع تبعا إلى ال مستضدي الخطيئة المبدأ مايو لديك آثار سلبية30.

رغمجمعيةدراسات مثل دراساتنا لا يمكن رسميًا ديfiشمال شرق السببية, ال تداعيات من ملكنا النتائج واضحة:حصانة إلى HCV مايو يحمي إلى بعض مدى ضد السارس-CoV-2 استحواذ، ومايو تزود a تعزيز إلى ال تطوير السارس-CoV-2 محددfic حصانة و مع هذه أدنى ال مخاطرة إلى عن علىشديدةالعلاج في المستشفيات.  A  محتشمالتأثير الوقائي للـ HCoVحصانة سيكون يكون a معقول تفسير إلى عن على ال عالينسبةمن asympطماطم و لطيف السارس-CoV-2 الالتهابات52,53. حتى أكثر مثيرة للاهتمام هي وجهات نظر المستقبل. كآخرين ونحنلديك مبين, السارس-CoV-2 و HCV حصانة إلى عدوى نكونغالباً ليس طويل-دائم (تين. 5, تكميلي تين. 11)5,54، قيدالذي - التي  السارس-CoV-2  اللقاحاتأملإلىالتغلب على. ينبغي السارس-CoV-2  استجاباتفيمنعطف أو دورتزوددرجة من الدفاع ضد التهاب الكبد عدوى, واسع الحماية ضد فيروسات كورونا قد يكون في صكل.

تين. 8 تأثير من HCoV حصانة على مرض فيروس كورونا-19 خطورة. a منظمة من العلاج في المستشفيات الحالة (ليس في المستشفى (N = 16); في المستشفى ليس في وحدة العناية المركزة(N = 42); في المستشفى في وحدة العناية المركزة (N = 22)) و عالي أو قليل مفتش HCoV التفاعلية. مستطيل الأحجام تطابق إلى ال نسبة من متضمن المرضى. b تأثير HCoV التفاعلية (قليل/عالي) على ال العلاج في المستشفيات الحالة في a مجموعة فرعية من N = 80 المرضى, كما مُقدَّر مع احتمال النسب, في ا ترتيبي تراجع (مع المستويات = ليس في المستشفى (N = 16); في المستشفى ليس في وحدة العناية المركزة (N = 42); في المستشفى في وحدة العناية المركزة (N = 22)) و a جمارك تراجع (المرجعي = ليس في المستشفى(N = 16); عكس الكل في المستشفى (N = 64)). بيانات هو قدم كما معامل تقدير و انها95 بالمائةكونيدنس فترة. مستوى من أهمية من المعلمة هو تم الحصول عليها مع a اثنين-جانب t-اختبار (p-القيمة هو عرض إذا <>خلاف ذلك مبين كما n.s.).

أنارعشة

بشر عينة. مصل وعينات البلازما جمعت قبل وبعد ظهور

SARS-CoV -2 بوصةسويسرا (قبل وبعد فبراير 2020, على التوالى) كانوامتضمن. رقم صبور التسجيل كنت أُجرِي إلى عن على ال الحالي دراسة. الجميعالتجارب تنطوي عينات من بشري المتبرعين كانوا أُجرِي بموافقة الاستجابةالكتاب محلي أخلاق لجنة (كانتونالي Ethikkommission) زيورخ,

سويسرا (BASEC نرس 2020-01327, 2020-00363 ؛ 2021-00437 ؛ 2020-00787) ، بقلم ال الأحكام من ال إعلان من هلسنكي و ال سريري جيد يمارس القواعد الارشادية من المؤتمر الدولي للمواءمة. عينات كانوا تم الحصول عليها من المصادر التالية: (1) التبرع بالدم في زيورخخدميإس (ZHBDS): مجهول صحي بالغ بلازما من قبل-جائحة زمننقاط (يناير 2019, مايو 2019,ويناير 2020) ومن الموجة الأولى من جائحة في زيورخ ، سويسرا (مايو 2020) كانوا قدمت بواسطة ال ZHBDS داخلي مستودع وسلبيات المصلالأنف والحنجرة إلى عن على هذه دراسة كنت تنازل بواسطة ال أخلاق لجنة(BASEC 2021-00437). (ثانيا) مجهول العينات المتبقية من التشخيص الروتيني في ال معهد من طبي علم الفيروسات, جامعة من زيورخ, ال أطفال الجامعة مستشفى زيورخ ، و ال كانتون مستشفى فينترتور (BASEC نرس2020-01327, 2021-00437). تم الحصول على الموافقة المسبقة الخطية من جميع المشاركينعينة واs مأخوذ أثناء ال جائحة في ال جامعة مستشفىزيورخ (BASEC 2020-01327). لعينات الوباء من المستشفيات الأخرى أd قبلجائحة عينات موافقة كنت تنازل بواسطة ال أخلاق لجنة. (ثالثا) الرعاية الصحيةالعمال الذين يعانون من فيروس كورونا المستجد من فيروس السارس -2 المضاد لـ RT-PCR يصابون بالعدوىأيون مشاركة في a دراسة في ال جامعة مستشفى زيورخ (BASEC 2020-00363). مكتوبة اطلاع كانت الموافقة تم الحصول عليها من الكل المشاركين. (رابعا) ذكر بلازما المتبرعين مشاركة في السارس-CoV-2 بلازما علاج نفسي دراسة أجريت في مستشفى جامعة زيورخ(CPT-ZHP, سويس ميديك 2020تي بي بي1004; أساسي 2020-00787). أبلغ مكتوبةتم الحصول على الموافقة على البحث من جميع المشاركين. تيهو التقارير من الكل بشري وباتيNT بياناتيتوافق معالستروب بيان. قبل-جائحة (السارس- CoV -2 نيجاتىهاء, N = 825) و يخدعfirmed السارس-CoV-2 إيجابي عينات (N = 389)كانوا منقسم داخل تمرين و تصديق الأفواج (تكميلي الطاولة 3).          الديموغرافيات المتاحةتا على جنس, سن, زمن حيث إيجابي RT-PCR وsymptom بداية, و العلاج في المستشفيات الحالة نكون ذكرت في تكميلي الطاولة 11.ال السارس-CoV-2 تمرين الفوج (N = 175) يشمل البلازما التي تم جمعها أثناءالعدوى (N=114) والنقاهة (N=61). لكل دأو فقط واحد أخذ العينات زمنتم تضمين نقطة ، لونgitudinal عينات من المتبرعين متضمن في ال تمرين كانت الفوج ليس متضمن في ال تصديق الفوج للتأكد من الاستقلال عندماالتقييم ال حساسية ومدينة محددة من طرق التشخيص المختلفة. ال   سارس-CoV-2 تصديق الفوج (N = 214), تتألف بلازما جمعت أثناء الإصابة (N = 90 ، نقطة زمنية واحدة لأخذ العينات لكل متبرع) والنقاهة

(N = 124، 79 مريضا نقاهة مع 1-4 عينات طولية). عدة مراتنقاط من التماثل للشفاء المرضى كانوا متضمن في ال مجموعة بيانات التحقق لالتقاط أ طيف واسع من ثأنينج جسم مضاد التتر. مستعرضة التحليلات كنت على أساس علىعينات مع معروف زمن حيث إيجابي RT-PCR (N = 369) أو معروف زمن منذ الأعراض بداية (N = 333) ، بما في ذلك ملاحظات التحليل الطولية.كلاهما ، الوقت منذ RT-PCR الإيجابي والوقتحيث بداية كنت معروف إلى عن على330 عينة، بمتوسط ​​زمن قدره ثلاثة أيامنعم ما بين علامة مرض بداية و RT-PCR(1شارع–3بحث وتطويرالربع: 1-7 أيام). استند التحليل الطولي لتفاعل الجسم المضاد على 251 ملاحظة من 120 نقاهةسنت المرضى مع معروف زمن حيث إيجابي RT-PCR والوقت منذ ظهور الأعراض. تحييد واs تقاس على 467 SARS-CoV -2 RT-PCRإيجابي عينات (N = 369 مع معروف زمن حيث RT إيجابية-PCR, N = 333 مع معروف زمن حيث علامة مرض بداية).

قمنا أيضًا بتقييم التفاعل التبادلي ABCORA 2. 0 و 5. 0 في ليفt-خلال بلازمامن التشخيص الروتيني في مجموعة مراقبة ما قبل الجائحة ثإيث موثقة, HCV الأخيرة عدوى (تمرين ثانيًا, N = 75; OC43 (N = 27), HKU1 (N = 17), NL63      (N = 22), 229E (N = 9)). تعميم HCV هو عادة فقط فحص إلى عن على فيفي المستشفى ، والتهابات الجهاز التنفسي الحادة وضعف المناعة فرادىالذين يخضعون بشكل روتيني لإخوانهميلادي تحري إلى عن على تنفسي الالتهابات. بالتالي, في هذا المريض مجموعة، على حد سواء انخفاض جسم مضاد التفاعلية بسبب إلى منيع مساومة أوارتفاع HCV وعظم الساق التفاعلية بسبب إلى مؤخرًا أو يتكرر HCV عدوى مايوتحدث. لأن هذه المجموعة هي التشخيصبشكل ثابت ذو صلة نحن يعتبر هو - هي حصيف إلى تضمين هذا الفوج كما تمرين ثانيًا بيانات تعيين إلى تحقق إذا الاعتراض-التفاعلية مع السارس-CoV-2 فيأبكورا يحدث في هذا الإعداد. لم يتم تضمين بيانات التدريب II في العتبة ديfinition إلى ليس خلال-يمثل فرادى بمرض شديد. هذا المصاب بفيروس التهاب الكبدمجموعة عرض شاملة أدنى التفاعلية مع السارس-CoV-2 من البلازما منصحي الكبار لكن المهم أظهر رقم دلالة من عبر التفاعل (الشكل.1a, b). مستنقع الوباءليه من مجهول الدم المتبرعين مع مجهول السارس-CoV-2الحالة جمعت في مايو 2020 (N = 672) كانوا ليس متضمن في تمرين والتحقق من الصحة الأفواج.

الكواشف وخطوط الخلايا. صاحب تيمسن السارس-CoV-2-مستمد المستضدات (مستقبل

مجال الربط (RBD) ، الوحدة الفرعية S1 (S1) ، الوحدة الفرعية S2 (S2) ، nuclيوكابسيد بروتين (N)) و S1 من رهو أربعة تعميم HCoVs (HKU1, OC43, NL63, 229E) كانوا تم شراؤها من Sino Biological Europe Gmب, اشبورن, ألمانيا (تكميليالطاولة 12). المصادر والمواصفات وتركيز الكشف عن الأجسام المضادة ومراقبتها والأمصال المستخدمة في ABCORA واختبارات التعادلts نكون المدرجة في الجدول التكميلي 13. 293- تم الحصول على الخلايا التائية من American Type Culture Collection(ATCC CRL- 11268)55. HT1080/أجاد2cl. 14 الخلايا33 كانوا يرجى مقدمة من P.بينياس, روكفلر جامعة, نيويورك. كلاهما زنزانة خطوط كانوا مثقف في DMEMيحتوينانوغرام10 في المئةFCS.

تصميم من متعدد حبة فحص أبكورا 2.0. نحن أنشئت اثنين حبة-على أساسمتعدد السارس- CoV-2 المناعية (أبكورا 2.0 و أبكورا 5.0) الذي - التيتضمنت مجموعة من SARS-CoV -2 و H.CoV المستضدات (سينو بيولوجي أوروباGmbH ، إشبورن ، ألمانيا ، الجدول التكميلي 12). أربعة مضاد لـ SARS-CoV -2نانوثانية- RBD, S1, S2, و N - كانوا متضمن في على حد سواء أبكورا 2.0 و أبكورا 5.0.أنكورا 2.0 متضمن في إضافة S1 من HCV-HKU1 وأبكورا 5.0 متضمن S1من الكل تعميم HCoVs (HCV-NL63, HCV-229E, HCV-HKU1, HCV-OC43). في مختصر, فرد MagPlex خرز (لومينيكس مؤسَّسة, أوستين, TX)    مع uniqأوي فلوري حبة المناطق كانوا اختيار إلى عن على كل مولد المضاد, خرز كانوامقترنة ومخاليط من حبة مقترنة بمستضدsكانوامحتضن مع صبور بلازما في a 96-نحن سوف لوحة تعيين-فوق. الالوسيط فلوري الشدة (MFI) من البلازما المرتبطة بالخرزانتيبالهيئات كنت تقاس الاستفادة a فليكس ماب 3D قارئ (لومينيكس مؤسَّسة,أوستين, TX). نحن مصمم ال فحص إلى فولfiليرة لبنانية ال التالية معايير: (i) عالي سرعة-cifiمدينة, حساسية، و قابلية اعادة الأنتاج, (ثانيا) مرن متعدد التصميم الذي - التي يسمح مباشرة إضافة و/أو تغيير من المستضدات; (ثالثا) واسع متحرك نطاق;  (رابعا) اختياري الكمياتfiالكاتيون من جسم مضاد استجابات; (v) اختياري تسجيل منضد الجسمالردود على HCoVs و (6) استخدامها في الروتينيةشمال شرق التشخيص و ابحاث.

اخترنا معقمة اتجاه إلتقاط عبر مضاد-له الأجسام المضادة إلى يضمن a عرض مستضد متجانس. لذلك ، كربوكسيل مagPlex خرز (لومينيكس

مؤسَّسة, أوستين, TX) كانوا مقرون مع مضاد-له جسم مضاد (سينو بيولوجي

أوروبا GmbH, اشبورن,ألمانيا ، الجدول التكميلي 13) ثم اقترن مع له الموسومةالمستضدات استخدام السيرة الذاتية-بلكس أمين اقتران (السيرة الذاتية-راد مختبراتAG ، Cressier ، سويسرا) وفقًا لشركة التصنيع instructions و كماوصفها56.

تعتبر معايرة المصل / البلازما بشكل عام أكثر السلالات دقةتيغي إلىاسترجاعحواء كمي معلومة على جسم مضاد التفاعلية. لكن, في التشخيص استعمالالاختبارات بشكل مثالي ينبغي ايصال (نصف)-كمي معلومة من a مصل واحدتخفيف إلى يسمح إنتاجية كافية. غطت شروط الفحص nalized أ 2- سجل نطاق MFI عبر جميع مجموعات مستضد Ig التي تم فحصها (الشكل التكميلي 1).التصديق ال صلاحية من استخدام a غير مرتبطة بلازما تخفيف, نحن يخدعfirmed الذي - التي بلازمامن السارس-CoV-2 إيجابي المرضى و قبل-جائحة السارس-CoV-2نفيتظهر عينات البلازما الاستجابة المثلى للجرعة المنحنيات خلال a واسع بلازما تخفيفنطاق (تكميلي تين. 1f). الأهم, a 1/100 تخفيف من بلازما كنت في الكلحالات أغلق إلى أقصى إشارة ، مع التأكيد على أن البلازما المتزايدةلن يؤدي التركيز إلى زيادة شدة الإشارة بل يؤدي إلى زيادة حدتهاإيه تناقصسابنات بسبب إلى prozone تأثيرات (تكميلي تين. 1f).

الحد الأقصى مضاد-له جسم مضاد جار التحميل كنت حقق في 5 µg جسم مضاد لكل مليونالخرز (Supplemدخول تين. 1c) و تستخدم كما a اساسي اقتران حالة. في ال fiنالبروتوكول,تم تحضين أكثر من خمسة ملايين حبة مغناطيسية مقترنة بالأجسام المضادة له-الموسومة المستضدات مخفف في برنامج تلفزيوني بتركيز 320 نانومتر.الأجسام المضادة الثانوية التي تحمل علامات Phycoerythrin (PE) الخاصة بـ IgG ، IgA أو IgM كانواتستخدم كأجسام مضادة للكشف (تكميليالطاولة 13). جودة مراقبة من الالمستضد الصغرىيدين كنت إجراء بواسطة احتضان ال خرز مع وحيدة النسيلةتستهدف الأجسام المضادة CoV-d المقابلأشعلت مولد المضاد كما مفصلة فيالجدول التكميلي 12. تم إجراء التحليل بذكاءh ال فليكس ماب 3D قارئ(Luminex Corporation, أوستين, TX) مع ال استحواذ من في الأقل 50 خرز لكلمنطقة حبة. النتائج أيكرر مسجل كما MFI لكل حبة منطقة.

تم وضع العديد من تدابير الرقابةalled إلى تأكدبين و داخل-فحصأداء. للتأكد من اختبار منخفض إلى-فحص تقلبية, كبير دفعات منالفردية المحملة بالمستضد بeads كانوا أعدت و مجمدة في قسامات حتى تستخدم في-20 درجةC إلى راوغالتسوس من ال مولد المضاد-مقرون حبات (الشكل التكميلي 1). تم خلط الخرزات المزدوجة المزدوجة في يوم الاختبار إلى yiالحقل ال مطلوب مولد المضادكوكتيل حبة. احتوت الكوكتيلات على 60 خرزة صإيه حبة منطقة لكل µl. في إضافة إلىمناطق حبة SARS-CoV -2 و HCV ، كل كوكتيل يحتوي على فراغy منطقة حبة (رقم مولد المضاد مقرون) إلى مراقبة إلى عن على غير محددfic ربط. جودة التحكم والتحقق من الصحة إجراءات إلى عن على ال فليكس ماب 3D أداة كانوا فعله على كل يوم التابعلجنة التنسيق الإداريةأودينغ إلىالالصانع's تعليمات. ال تقلبية من ال فحصكنت تحليلها كما يتبع56: بلازما عينات من 20 RT-PCR يخدعfirmed السارس- CoV- تم تجميع واختبار 2 مريض مصابالإصدار a نطاق من سبعة التخفيفات في 31  ر مختلفالتكرارات إجراء على 10 مختلف أيام (تكميلي تين. 2). بجانبالكل المستضدات و إيغ الطبقات, إشارات كانوا المحتجزة خلال ال اختبار فترة من 25بعد أيام اقتران حبة. معاملات التباين (CV) للإشارة الملزمة عبر tالتكراراتمن 12 مجموعة من فئة مستضد Igالدول اثبت قليل (نطاق: 0.010–0. 128, الوسيط  0. 059 ، الشكل التكميلي 3 ج ، د ، الجداول التكميلية 1 ، 2). في نفس اليوم ويومًا بعد يومتقلب صمتجول قليل و قابلة للمقارنة (تكميلي تين. 3e, f). أقل a 1/ 100 بلازما تركيز, السيرة الذاتية زيادة بشكل ملحوظ (تكميلي الشكل ثلاثي الأبعاد) ،         حدد 1/100 كأعلى تركيزعلى (أدنى بلازما تخفيف) إلى يكون تم اختباره في ال فحص. وهكذا تم تحديد تخفيف البلازما 1/100 على أنه الأساسيتخفيف إلى عن على تحري بلازما في أبكورا 2.0 متى a نوعي (أي وجود أو عدم وجود فيروس سارس- 2أجسام مضادة محددة) أو قراءة شبه كمية (أي كثافة إشارة MFI) هيrمتساوي.

كانت جميع قياسات ABCORA ديمزق من غير مرتبطة قياسات ما لميذكر خلاف ذلك. لقياس SARS-CoV محدد -2c الأجسام المضادة في صبور بلازما,معطل بالحرارة بلازما (1 h في56 درجةC) كنت مخفف 1/100 في برنامج تلفزيوني-BSA1 بالمائةما لميذكر خلاف ذلك. 50 ميكرولتر مخففإد بلازما كانوا محتضن مع 50 µl من ال أبكورامولد المضاد حبة كوكتيل إلى عن على 30 الدقائق في مجال درجة الحرارة في 96-أطباق جيدة ، مغسولة ثلاث مرات مع PBS-BSA 1 بالمائة ، وحضنت في تفاعلات منفصلة معال phycoerythrin (PE)-المسمى كاشف الأجسام المضادة إلى عن على مفتش, إيغا أو IgM في a fiتركيز nal من 1/500 في PBS-BSA 1 بالمائة. تم تحديد هذا التخفيف مسبقًا بواسطةمعايرة الأجسام المضادة للكاشف للحصول على إشارات MFI المثلى. بعد 45 مinutes منحضانة في درجة حرارة الغرفة ، تم غسل الخرز ثلاث مرات مع PBS-BSA1 بالمائةو تحليلها في 96-نحن سوف لوحات على قارئ FlexMap 3D (Luminex Corporation ، أوستن, TX). A الحد الأدنى من 50 حبة يقرأ لكل مولد المضاد كنت مكتسب.

للسيطرة على الأجسام المضادة عبر رد الفعل الحقيقيالذباب, كل بلازما عينة كنتتم تقييمه مع beaس بدون مولد المضاد (فارغة حبة مراقبة) في مزيج أيّكل كاشف أntibody. إلى عن على التحليلات, الخام MFI القيم كانوا تحول إلى MFI-عدو إلى صحيح إلى عن على معرفتي ربط.أنشأنا يعني خرزة فارغة MFI-FOE لـ IgG و IgA و IgM للمتبرعين الأصحاء قبل الجائحة (N=1016) وما إلى ذلكt المعنى MFI-عدوزائد4x الانحراف المعياري كعتبة للتحكم في الخرزة الفارغة.في مطلق المستويات, هؤلاء الحدود القصوى بلغت إلى MFI-FOE 41.58 (IgG) ، 55.91 (IgA) ، و 269.47 (IgM).Mإرتفاعات إلى عن على أيّ ال فارغة حبة مراقبة مسجل القيم ابوهاء هذه عتبة كانوا يعتبر غير صالحة و معاد.

تم إعداد كل لوحة بئر لتحليل Luminex 96- على contaفي ال نفس تعيين منمراقبة عينات, يسمى 7 مسلسل 4-يطوى التخفيفات من -2 تحكم إيجابي في SARS-CoVجهات مانحة حمام سباحة (N = 20 المتبرعين, بدء تخفيف 1/100, تكميلي تين. 1f) و قبل-جائحة صحي جهات مانحة حمام سباحة (تخفيف 1/100, N =20 جهة مانحة تكميليةالشكل 1 و). تسمح هذه الضوابط الإيجابية والسلبية بالتحكم في أداء الفحصنيسعبر قياسات مستقلة بالإضافة إلى تمكينبأثر رجعيالتقييس مقابل الضوابط الخارجية إذا لزم الأمرالخصم.

تعريف من السارس-CoV-2 الإيجابية المصلية في أبكورا 2.0 و أبكورا 5.0. إلىتمييز SARS-CoV -2- محددًا عن الأجسام المضادة التبادلية ، فنحن دefiنيد MFI- حدود FOE لكل من 12 مستضد SARS-CoV -2 ومجموعة من فئة Igs على أساس إعادة الأجسام المضادة للبلازمانشاط في تمرين الأفواج (تكميلي الجداول 3 و 4). وشملت هذه الجهات المانحة الصحية قبل الجائحة pلازما (تمرين I, N = 573),المتبرعين مع مؤخرًا HCV عدوى (تمرين ثانيًا, N = 75; OC43 (N = 27), HKU1 (N = 17), NL63 (N = 22), 229E (N=9)) والمتبرعون المصابون بعدوى SARS-CoV -2 (تمرين ثالثا, N = 175). الحدود القصوى كانوا تعيين إلى قللايجابيات مزيفةفي حين ضمان حساسية إلى عن على السارس-CoV-2الكشف عن الأجسام المضادة والوصول إلىالمواصفات الشاملة للمدينة أعلاهe99 بالمائةو متضمن المستويات إلى عن على الحدود-خط التفاعلية إلى عن على مفتشRBD ،مفتش S1, و مفتش N إلى السماح ايضا محتشم جسم مضاد التفاعلية إلى هؤلاء المستضدات to يكون فحص. MFI-عدو يقرأ من فرد عينات كانوا تحول داخلقيم انقطاع الإشارة (SOC) (MFI-FOE / العتبة). SOC ضدalues نكون تستخدم إلى عن علىتقويماتيغنى إيجابي التفاعلية إلى عن على كل فرد مولد المضاد-جسم مضاد صف دراسي مزيج, مع SOC> 1 تدل على التفاعل الإيجابي ، و SOC <1 تدل على التفاعل السلبي.متي ضبط فرد الحدود القصوى, هو - هي يجب يكون يعتبر الذي - التي إلى عن على كل من ال 12 سبر أنشطة قد تحدث التفاعلات المتقاطعة. مع 12 معلمة SOC فردية مسجل ، SPE الشاملةcifiمدينة إرادة تخفيض إذا أي إيجابي شركة نفط الجنوب بشكل مستقل suffiسيس إلى معدل a عينة شاملة كما السارس-CoV-2 جسم مضاد إيجابي. إلى تجسد:بافتراض الاستجابات المستقلة ، حتى نسبة عالية تصل إلى 99 في المائة من المدينة المحددة لكل مستضد ستضيف to انخفاض إجمالي بنسبة 88 في المائة في مدينة محددة عبر الاختبار بأكمله. لذلك نحن المطلوبين لr السارس-CoV-2 إيجابي الاتصال في أبكورا 2.0 a الحد الأدنى من اثنين محددfiمدن إلى تصلنشاط في الاعلىالعتبة. تستخدم قيم SOC المجمعة لتحديد الكلتم تفصيل الحالة المصلية لعينة معينة في الجدول التكميلي 5. بالنسبة لـ IgG RBD, S1, و N,التي سجلنا لها أيضًا نشاط SOC عبر الحدود ، سمحنا بامتدادمزيج من تفاعل مستضد واحد SOC> 1 ، التفاعل الثاني SOC> حد. ال fiنال عتبة و إيجابي مكالمة معايير مسموح إلى عن على التفاضل من جزئي (مبكر الانقلاب المصلي مع فقط IgM و إيغا استجابات) إلى ممتلئ سر-          التحويل (including مفتش استجابات) (تكميلي الطاولة 5). في إضافة, المعايير تدل على عينات ذات تفاعل ضعيف و / أو تفاعل غير محدد(الجدول التكميلي 5).

لتسهيل المقارنة بينعين أبكورا 2.0 و أبكورا 5.0 ال نفسعتبة تم استخدام القطع مع ABCORA 5. 0. لقد اخترنا عدم إنشاء قطع محددعتبات تفاعل الجسم المضاد لفيروس التهاب الكبد الوبائي ك an دقيق ديfinition من a نفيالاستجابة معقدة بسبب التعرض الواسع لفيروسات التهاب الكبد الوبائي وفيروس نقص المناعة البشريةاشتقاقهتفاعل متصالب للأجسام المضادةtivity ما بين هم. HCV استجابات كانوا ومع ذلك متضمن في الإحصاءكال التحليلات كما MFI-عدو القيم.

تعريف من السارس-CoV-2 الإيجابية المصلية استخدام جمارك تراجع تصنيف.

كلاسيfiالكاتيون من مصل عكس سلبي عينات في تم تحقيق ABCORA 2. 1استخدامجمارك تراجع. ال مطابق تمرين و تصديق بيانات تستخدم إلى عن على ال مؤسسة من أبكورا 2.0 كانوا تستخدم. كما ال ABCORA 2. 0 عمليات نشاط الربط كانت مرتبطة بشكل كبير ، قمنا بتضمين المتغيرات التالية في النموذج (تكميلي تين. 6a): ال يعني القيمة من بين جميع استجابات IgG MFI-FOE (RBD ، S1 ، S2 ، N) ، فإن يعني القيمة من استجابات IgA MFI-FOE ضد RBD و S1 و S2 والمتوسط قيمة استجابات IgM MFI FOE ضد RBD و S1 و S2. استجابة IgA و IgMs إلى N تم استبعادها لأنها لم تكن مجمعة مع الردود الأخرى من نفس Ig صف دراسي (تكميلي تين. 6 أ). تم استخدام الانحدار اللوجستي للتقدير والتنبؤ احتمال عينة معينةe إلى يكون إيجابي (p) كما وصفها في معادلة (1).

الفقرةأمتار  0, G, A, و  M كانوا مُقدَّر على ال تمرين مجموعة البيانات. A عينة ثم تم تعريفه على أنه إيجابي إذا كانت احتمالية أن تكون إيجابية أعلى من ذلكa عتبة c/. تم تحديد هذا الحد للحصول على مدينة محددة لا تقل عن 0. 99 و الحساسية القصوى على مجموعة بيانات التدريب (على نحو مشابه to c إلى عن على ال عشوائي غابة). فيملخص, في أبكورا 2. 1، أي عينة جديدة تُعرف على أنها إيجابية مصل إذا كان احتمالها من كونها موجبة للمصل حسب تقدير الانحدار اللوجستي أعلى من ج /. يحلل نحنre تم إجراؤه بصيغة Rn 3.6.3. تعريف من السارس-CoV-2 الإيجابية المصلية استخدام عشوائي غابة تصنيف.  تصنيف المصل الخامسرسوس سلبي عينات فيالسياق الكلام من أنكورا 2. 0 و ABCORA 5. 0 كان حقيقيًاليز استخدام a عشوائي غابة يقترب التالية الالإعداد الأساسي لـ rاندوم الغابات كما وصفها في57. ال عشوائي غابة بحد ذاتها كنت مبني مجموعة من 1000 شجرة تصنيف باستخدام استجابات MFI-FOE (IgA ، IgG ،وIgM مقابل RBD ، S1 ، S2 ،N). ال احتمالا من a عينة كون إيجابي كما قبل-  تمليها الغابة العشوائية هو متوسط ​​pإمكانيات خلال الكل 1000 الأشجار. أخيرًا ، العينة دينيد كما إيجابي إذا انها احتمالا من كون إيجابي هو في الاعلى a عتبةld c, أيّ هو ديfiنيد كما إلى الحصول على a محددfiمدينة من في الأقل 0.99 و a الحد الأقصى الحساسية في القطارعمل مجموعة البيانات. في ملخص, أي الجديد عينة هو ديfiنيد كمامصلي إذا أناts احتمالا من كون مصل كما مُقدَّر بواسطة ال عشوائيالغابة فوق العبالعتبة c. نحن أُجرِي a سلسلة من عشوائي غابة التحليلات التي أخذت في الاعتبار إما استجابات SARS-CoV -2 فقط أو SARS-CoV -2 و HCV   استجابات في ABCORA 2. 0 و ABCORA 5. 0: كان ABCORA 2.2 و ABCORA 2.3تم تدريبه و تستخدم إلى عن على تنبؤ على أبكورا 2.0 بيانات و متضمن فقط السارس-  CoV-2 استجابات أو السارس-استجابات CoV -2 و HKU1 على التوالي. ANCORA 5.4.2 تحديث (استجابات SARS-CoV -2 فقط) و ABCORA 5.5 (SARS-CoV-2 و HCVاستجابات) كانوا تم تدريبه على أبكورا 5. 0 البيانات. تفاصيل حول إدراج البيانات الخاصة بـ خاص به عارضات ازياء نكون المدرجة في تكميلي الطاولة 3 و تكميلي الطاولة 10. تم إجراء التحليلات في الإصدار R 3.6.3 باستخدام الحزمةإس عشوائي و     الحارس58–61.

لضمان متانة نتائجنا ، أجرينا نفس الشيءحساسية التحليلات عن طريق التوزيع العشوائي مجموعات بيانات التدريب والتحقق من الصحة باستخدام 5- أضعاف التحقق من الصحةطريقة. كلا المجموعتينمن إيجابي و السلبيات عينات كانوا منقسم داخل fiهاء مساوالقطع و نحن ديfiنيد الذي - التي طريق fiهاء تصديق مجموعات (تتكون من ال i-العاشر تعيين منايجابيات وال i-العاشر تعيين من السلبيات, i = 1.5). ال راحة من ال بيانات كنت تستخدم إلى عن علىتمرين ال أبكورا 2.3 غابة عشوائية. لكل مجموعة تحقق ، والمدينة المحددة وحساسية من ال عشوائي غابة كانوا محسوب على ال تمرين, تصديق، والتدريبزائدتصديق مجموعات (تكميلي الجدول 6).

تصديق و تَحَقّق استخدام خارجي ضوابط. نحن تستخدم ال مضاد-السارس-  -2 لوحة التحقق من فحوصات الأمصال (NIBSC الشفرة: 20/B770, NIBSC) إلىتحقق من أداء اختبار ABCORA 2. 0 و ABCORA 2.3. مصلsأمبليسمن ال فيريfiالكاتيون فريق تقاس بواسطة ABCORA 2. 0 / 2.3 كما هو موضح والنتائجمقارنة بنتائج الفحوصات المتاحة تجارياً التي أبلغت عنها NIBSC (32 والجدول التكميلي 7). نحن متورطونلها فيريfiإد ال حساسية من ال أبكورا 2 اختبار في كشف السارس-CoV-2 عدوى في مقارنة مباشرة مع التجاريةالاختبارات. أنتيباودي الحالة من بلازما من السارس-CoV-2 إيجابي فرادى (N = 171) تم تحليلهd مع ال التالية اختبار الأنظمة: متضمن اختبار الأنظمة المستهدفة ال N بروتين (إليكسيس® مضاد-السارس-CoV-2 (Roche Diagnostics GmbH)) ، منطقة RBD من ال S بروتين (إليكسيس® مضاد-السارس-CoV-2 مقايسة S (Roche Diagnostics GmbH)) ،و ال S1 الوحدة الفرعية (EUROIMMUN مضاد-السارس-CoV-2 إليسا (مفتش)) (تكميليالجدول 8). تم إجراء جميع المقايسات وفقًا لـال الصانع'تعليمات ق في ال التشخيص وحدة من ال معهد من طبي علم الفيروسات, جامعة ال زيورخ, سويسرا.