دراسة الحالات والشواهد لعدوى كلوستريديوم إينوكيوم، تايوان

لقاح كلوستريديوم المقاوم للفانكومايسينتم تحديده مؤخرًا كعامل مسبب للمرضالإسهال المرتبط بالمضادات الحيويةفي البشر. أجرينا دراسة الحالات والشواهد التي شملت 152 مريضًا مصابًا باللقاح C. من 2014– 2019 في تايوان، باستخدام 304 حالة من عدوى المطثية العسيرة (CDI) المتطابقة مع سنة التشخيص والعمر ({{7 }} سنوات)، والجنس كعناصر تحكم. وكانت الخصائص الأساسية مماثلة بين المجموعتين. C. عانى المرضى المصابون بالعدوى من عدوى المطثية خارج الأمعاء ومضاعفات مرتبطة بالجهاز الهضمي أكثر من المرضى الذين يعانون من CDI. كان معدل الوفيات لمدة 30-يومًا بين المرضى المصابين بعدوى المطثية المعدية 14.5%، وكان المعدل الإجمالي 23.0%.مرض الكلى المزمن, ورم صلبوكان القبول في وحدة العناية المركزة وحالة الصدمة 4 عوامل خطر مستقلة للوفاة. يجب التعرف على اللقاح جيم الذي تم تحديده من العينات السريرية باعتباره ممرضًا يتطلب العلاج، ونظرًا لمقاومته الجوهرية للفانكومايسين، فإن التحديد الدقيق ضروري لتوجيه العلاج المضاد للميكروبات المناسب وفي الوقت المناسب

عشب سوف تعرفهلأمراض الكلى

أنواع الكلوستريديوم are obligate anaerobic, endo-spore-forming bacilli that usually colonize the gastrointestinal tracts of humans. Of the >200 species of Clostridium, >30 من مسببات الأمراض المحتملة لدى البشر، مثل المطثية الحاطمة والمطثية الصعبة. ومع ذلك، نادرًا ما يتم وصف C. innocuum على أنها مرتبطة بمرض يصيب الإنسان. تم التعرف على لقاح C. لأول مرة في الستينيات بين 8 مرضى في الولايات المتحدة؛ الاسم، الفراغ، وصف افتقاره إلى الفوعة (1،2). كان من الصعب تمييز لقاح C. عن غيره

أنواع المطثية (خاصة C. ramosum و C. clostridia form، والتي تسمى معًا مجموعة RIC) بسبب أنماطها الظاهرية المتشابهة من التشكل الاستعماري غير التقليدي، وميزات تشكيل البوغ النادرة، ونمط الأحماض الدهنية (3-5). أصبح تحديد لقاح C. أسرع وأكثر دقة بعد إدخال التقنيات الجزيئية مثل تسلسل الحمض النووي الريبي 16S وقياس الطيف الكتلي لامتصاص/تأين الليزر المرتبط بالمصفوفة في وقت الرحلة (MALDI-TOF) (6).

في عام 1995، كوترونا وآخرون. تم الإبلاغ عن الحالة الأولى لالتهاب الشغاف الناجم عن C. innocuum (7). على الرغم من أن هذه البكتيريا كانت تعتبر أقل تسببًا للأمراض ونادرًا ما تسبب العدوى في السابق، فقد ظهرت المزيد والمزيد من الأدلة السريرية منذ العقد الأول من القرن الحادي والعشرين، مما يشير إلى أن لقاح المطثية قد يكون سببًا محتملاً للإسهال المرتبط بالمضادات الحيوية والعدوى المطثية خارج الأمعاء (EICI)، مثل تجرثم الدم. والعدوى داخل البطن والتهاب الشغاف (8-10). ومع ذلك، نحن لسنا على علم بدراسة عدوى C. innocuum مع مجموعة كبيرة بما يكفي من المرضى لوصف خصائصها السريرية.

يعد التشخيص الدقيق لـ C. inoculum ضروريًا بسبب مقاومته الجوهرية الفريدة للفانكومايسين، والتي يُفترض أنها ناجمة عن وجود جينين صبغيين يتيحان تخليق سلائف الببتيد-جليكان تنتهي في سيرين مع تقارب منخفض للفانكومايسين (9،11). على الرغم من أن الفانكومايسين هو أحد الأدوية المضادة للميكروبات الموصى بها لعلاج الالتهابات التي تسببها أنواع المطثية، وخاصة المطثية العسيرة، فإن المقاومة الجوهرية للفانكومايسين في لقاح المطثية المطثية تشكل خطر العلاج غير المناسب للمرضى الذين يصابون بعدوى لقاح المطثية (12). يعد C. diffi cile واحدًا من أكثر الأنواع الثلاثية تمثيلاً التي تسبب أمراضًا للإنسان وقد تم التحقيق فيها جيدًا. في الولايات المتحدة، تم تحديد ≈500,000 عدوى سنويًا، وارتبطت 15,000–30,000 حالة وفاة بعدوى المطثية العسيرة (CDI) (12-14)

في الدراسات السابقة، أظهرنا C. innocum كعامل ممرض غازي محتمل يسبب التهاب القولون الحاد وEICI في سلسلة حالات صغيرة وأثبتنا سميته الخلوية في المختبر (8،9). هنا، أجرينا دراسة الحالات والشواهد بأثر رجعي لوصف وتقييم الخصائص السريرية ونتائج العدوى الناجمة عن العدوى C.. تحقيقا لهذه الغاية، قمنا باختيار المرضى الذين يعانون من CDI كمجموعة مراقبة. وافقت مجالس مراجعة المعهد في مستشفى تشانغ غونغ ميمو ريال (CGMH؛ تاويوان، تايوان) على الدراسة، مما يسمح بمراجعة البيانات الطبية للمرضى (IRB#201900906B0). تم منح التنازل عن الموافقة نظرًا لطبيعة المشروع بأثر رجعي والتحليل المجهول للمعلومات السريرية للمرضى.

طُرق

تصميم الدراسة والإعداد السريري وتسجيل الحالة

We conducted a retrospective case-control study at CGMH during 2014–2019. CGMH is a tertiary medical center accommodating 3,700 patient beds. We selected C. difficile as the control to better illustrate the clinical features of C. innocuum infection. The case and control groups were assigned in a 1:2 ratio and matched in the diagnosed year, age +2 years, and sex. We identified cases with C. innocuum and C. difficile infections using the rapid ID 32A system (bioMérieux, https://www.biomerieux.com) and MALDI-TOF mass spectrometry Biotyper (Bruker Daltonik GmbH, https://www.bruker.com) (15– 17). MALDI-TOF mass spectrometry was introduced in 2009 in the clinical microbiology laboratory of CGMH, but C. innocuum was not reported routinely because it was considered a clinically insignificant microorganism. To trace the cases infected with C. inoculum, we reviewed the original reporting database from the MALDI-TOF mass spectrometry system directly and identified the samples reporting C. inoculum. Our definition of a microbiologically confirmed C. inoculum infection was that the original report from the MALDI-TOF mass spectrometry database revealed C. inoculum in the strongest 2 signals and had signal scores >2.00. قمنا بتعريف عدوى المطثية العسيرة بنفس المنطق. قمنا بمراجعة المعلومات الأساسية لكل مريض وقمنا بإدراج جميع المرضى الذين يعانون من عدوى C. inoculum في الدراسة. قمنا بتعريف عدوى المطثية العسيرة على أنها اختبار سم إيجابي قائم على PCR مع وجود أعراض سريرية متوافقة مع العدوى، أو ثقافة إيجابية للمطثية العسيرة مع أعراض سريرية متوافقة (على سبيل المثال، الإسهال الموثق أو المظاهر الإشعاعية لتضخم القولون السام). لقد استبعدنا الحالات المصاحبة لـ C. inoculum وC. difficile المعزولة من نفس العينة السريرية من الدراسة. من أجل مطابقة الحالات والشواهد، قام 3 مؤلفين (Y.-C. Chen، وY.-C. Kuo، وM.-C. Chen) بمراجعة المعلومات الأساسية لجميع الحالات المصابة بعدوى المطثية اللقاحية والمطثية العسيرة. لقد اخترنا بشكل عشوائي عنصري تحكم لكل حالة، متطابقين حسب سنة التشخيص والعمر (+2 سنة) وجنس حالة الفهرس. إذا لم تكن أي عناصر تحكم مؤهلة من هذه المتغيرات الثلاثة المطابقة، فقد قمنا بإسقاط معيار الجنس، متبوعًا بمعيار العمر إذا لزم الأمر. بعد عملية المطابقة، قمنا بمراجعة المعلومات السريرية لهؤلاء المرضى.

موارد البيانات السريرية والمتغيرات والتعريف

We collected demographic data, clinical manifestations, laboratory testing results, images, and mimicrobiology reports through an electronic medical record system (EMR). Demographic data were age, sex, race, underlying systemic diseases, and acquisition modality (community vs. hospital). We defined hospital-acquired infection as the symptoms that occurred>بعد 48 ساعة من القبول، أو<4 weeks after discharge from a healthcare facility; otherwise, it was classified as a community-acquired infection (18). We calculated the Charlson Comorbidity Index score for each patient to represent the baseline physiologic condition affected by an underlying disease. The index is composed of 19 underlying conditions in 4 categories. Each category had a weighted score based on the risk for 1- and 10-year mortality rate (19). We recorded clinical symptoms such as diarrhea, fever, bloody stool, abdominal pain, vomiting, and abdominal distension. We also reviewed disease-related complications, including toxic megacolon, ileus, bowel perforation, and shock. Recurrent infection was defined if the patient had a repeated microbiological culture from the same specimen source within 8 weeks of initial documented symptoms resolution (20,21). Outcome assessment includeed 30-day, 90-day, and overall deaths after the infection. We reviewed previous antibiotic exposures according to each class: penicillins, cephalosporins, carbapenems, fluoroquinolones, aminoglycosides, macrolides, tetracyclines, glycopeptides, oxazolines, polymyxins, lincosamides, and metronidazole. We defined antibiotic exposure rates as the percentage of patients who received any drugs <30 days before C. inoculum or C. difficile infection and duration of antibiotic exposure as the total days of any antimicrobial drug use in a patient <30 days before the event of C. inoculum or C. difficile infection.

العزلة البكتيرية وتحديد الهوية

أجرينا الثقافات البكتيرية اللاهوائية في مختبر علم الأحياء الدقيقة السريرية، كما هو موضح سابقا (9). قمنا بوضع جميع العينات اللاهوائية على صفيحة أجار الدم الانتقائية، بما في ذلك CDC-ANA BAP (صفيحة أجار الدم اللاهوائية)، وCDC-ANA-PEA (صفيحة أجار دم كحول فينيل إيثيل اللاهوائي)، وBBE/KVLB (باكتيرويديز الصفراء إيسكولين وكانامايسين المتسرب). لوحة ثنائية. قمنا بتحضين أطباق الآجار في الظروف الهوائية (90% N2 /10% CO2) عند 37 درجة لمدة 5 أيام. قمنا بمراجعة شاملة للمستعمرات المتنامية على طبق وقمنا بتحليل مستعمرة تمثيلية واحدة لكل طبق أجار بواسطة نظام ID 32A السريع (bioMérieux) لتحديد الكائنات الحية الدقيقة.

الجدول 1. الخصائص الأساسية والتشخيصات السريرية في مجموعتين من المرضى بواسطة أنواع المطثية المعدية في دراسة الحالات والشواهد لعدوى لقاح المطثية، تايوان*

اختبار الحساسية للمضادات الميكروبية

قمنا باختبار الحساسية المضادة للميكروبات تجاه الكليندامايسين والميترونيدازول والبنسلين والبيبيراسيلين والأمبيسيلين/السولباكتام بواسطة طريقة تخفيف أجار نقطة الانهيار وفقًا لمعايير معهد المعايير السريرية والمخبرية (الوثيقة M11-A8) للبكتيريا الهوائية (22) . استخدمنا معايير تفسيرية في الوثيقة M100S لتحديد القابلية (22).

التحليل الإحصائي

لقد أجرينا تحليلًا إحصائيًا بواسطة SPSS Statistics 24.0 (SPSS Inc., https://www.ibm.com/products/ spss-statistics). بالنسبة للمتغيرات المستمرة، قمنا بتحديد الأهمية باستخدام اختبار t المستقل أو اختبار Mann-Whitney U حسب الاقتضاء. إذا كان للمتغير المستمر قيم متطرفة ولم يتناسب مع التوزيع الطبيعي، فسيتم عرض المتغيرات كمتوسط ​​(المدى الربيعي، المدى). قمنا بتحليل المتغيرات الفئوية عن طريق اختبار χ2 واعتبرنا p<0.05 statistically significant. We obtained odds ratios (ORs) from cross-tabulation and analyzed the p-value of ORs by univariate logistic regression. We estimated the mortality rate at 30 days and 90 days after the positive culture and analyzed it by Kaplan-Meier survival analysis using methods described previously (23). In addition, we examined risk factors associated with 30- and 90-day mortality in both groups by logistic regression.