انتظام الأدوية للفشل الكلوي المزمن والآلية الكامنة على أساس التنقيب في البيانات ، وعلم الصيدلة الشبكي ، والالتحام الجزيئي

Jan 04, 2023

خلاصة:
الهدف: توضيح انتظام الأدوية في WU Zhao-dong ، كبير الأطباء المشهورين في الطب الصيني التقليدي (TCM) في مقاطعة Jiangxi ، والتحقيق في الآلية المحتملة للوصفات الجديدة المحتملة ضدالفشل الكلوي المزمن(CRF). الطريقة: تم جمع وصفات العيادات الخارجية الخاصة بـ WU Zhao-dong من يوليو 2019 إلى يوليو 2021. تم إجراء التنقيب عن البيانات باستخدام المنصة المساعدة للوراثة للطب الصيني التقليدي (V 2.5) لتحليل تواتر الأدوية وترابط الأدوية والحصول على الوصفات الطبية الجديدة المحتملة. تم تحليل التفاعل بين أهداف الأدوية في الوصفات الجديدة من خلال قاعدة بيانات علم الأدوية وأنظمة الطب الصيني التقليدي ومنصة التحليل (TCMSP و STRING وموسوعة كيوتو للجينات والجينوم (KEGG) ، متبوعًا بالتحقق من خلال الالتحام الجزيئي و
التجارب. النتيجة: تم فحص ما مجموعه 200 وصفة طبية ، مع 217 دواءً طبيًا صينيًا ، وتم اشتقاق ثماني وصفات طبية محتملة جديدة. على وجه التحديد ، الوصفة 1: أرميناكاي السائل المنوي أماروم-أستراغالي راديكس-بلاتيكودونيس راديكس-أنجيليكاي سينينسيس راديكس-سميلاسيس جلابرا ريزوما-مقلي أتراكتيلوديس ماكروسيفالي ريزوما ، الوصفة 2: Saposhnikoviae Radix-Schizonepetae Herba-Kochiae
Fructus-Asteris Radix et Rhizoma-Menthae Haplocalycis Herba ، وصفة طبية 3: Armeniacae Semen Amarum-Asteris Radix et Rhizoma-Platycodonis Radix-Eriobotryae أعد Folium Ephedrae Herba ، وصفة طبية 4: Perillae Caulis-Codonopse Radix : Ecliptae Herba-Astragali Radix Praeparata Cum Melle-Dryopteridis Crassirhizomatis Rhizoma-Rosae Laevigatae Fructus-Coicis
Semen-Ligustri Lucidi Fructus ، وصفة طبية 6: Lycopi Herba-Lonice Raejaponicae Caulis-Trachelospermi Caulis et Folium-Alismatis Rhizoma ، الوصفة 7: Scutellariae Radix-Hirudo-Paeoniae Radix Rubra-Eriobotryae Preshome-Gyrizoma Scrophulariae Radix-Chrysanthemi Indici Flos-Smilacis Glabrae Rhizoma- Serissae Herba. في الوصفة الطبية ، تم فحص 1،18 مكونًا كيميائيًا رئيسيًا. تم التنبؤ بثمانين هدفًا من المكونات النشطة للوصفة 1 ، وتم الحصول على 37 هدفًا محتملاً لعلاج CRF ، بما في ذلك إنترلوكين (IL) -6 وعامل نمو بطانة الأوعية الدموية (VEGF) والبروتياز الخاص بأسبارتات السيستينيل {{21}. }} (Caspase -3) ، سينثاز أكسيد النيتريك 3 (NOS3) ، والعامل المحفز لنقص الأكسجة -1 (HIF -1). مسارات KEGG المشاركة في أهداف الأدوية الطبية الصينية
واشتملت الأمراض بشكل أساسي على مسارات الإشارات الخاصة بالدهون وتصلب الشرايين ، ومستقبلات NF-κB ، والمستقبلات الشبيهة بالرسم ، و HIF -1. خفضت الوصفة 1 بشكل ملحوظ كرياتينين المصل ونتروجين اليوريا ، وزادت محتوى NO و NOS3 في أنسجة الكلى لجرذان CRF. الخلاصة: تُظهر الوصفة الطبية 1 خصائص العمل متعددة المكونات والأهداف ، وقد تكون آليتها مرتبطة بهاتثبيط التليف الكلوي,مضاد-
اشتعال,تحسين الإيكولوجيا الدقيقة المعوية،وتحسين نقص الأكسجة الكلوية ونقص التروية.
 
الكلمات الدالة:الفشل الكلوي المزمن؛ انتظام الدواء آلية الكامنة؛ بيانات التعدين؛ علم الصيدلة الشبكة الالتحام الجزيئي
الفشل الكلوي المزمن(CRF) هي مشكلة صحية عامة متنامية. في الوقت الحالي ، بلغ عدد مرضى CRF في بلدي 119 مليونًا. مع تسارع وتيرة الحياة والتغيرات في هيكل النظام الغذائي ، لا يزال عدد المرضى يتزايد عامًا بعد عام [1-2]. يتميز CRF بضرر لا رجعة فيه لوظيفة الكلى ، والإجهاد التأكسدي ، والالتهاب ، مما يؤدي في النهاية إلى تليف كلوي. في المرحلة المبكرة من CRF ، لا تظهر على معظمهم أعراض سريرية واضحة ، وفي المرحلة المتأخرة ، مع زيادة مستوى السموم الأيضية ، غالبًا ما تكون الأحشاء المتعددة متورطة. نظرًا لعدم وجود خيارات علاج فعالة ، فإن CRF لديها معدل وفيات مرتفع ، مما يشكل عبئًا ثقيلًا على الأسرة والمجتمع [3].
للطب الصيني التقليدي تاريخ طويل في علاج CRF ، والذي يمكن أن يخفف الأعراض السريرية بشكل فعال ويؤخر تقدم وظائف الكلى ، والتي لها مزايا فريدة. من حيث المسببات والمرضية ، يعتقد Zou Yanqin أن نقص الكلى هو المرض الرئيسي لـ CRF ، وأن الرطوبة وركود الدم هما المرضان الرئيسيان [4] ؛ يعتقد Zhang Xingping أن الكلى هي أصل الحيوية ، ونقص الحيوية هو السبب الجذري لـ CRF [5]. من حيث طرق العلاج ، يؤيد معظم الأطباء تمييز المتلازمة وعلاجها. صاغ Zhang Daning المبادئ الأساسية لتنشيط الكلى وتنشيط الدورة الدموية لعلاج السبب الجذري ، وتبديد الرطوبة وتقليل الأحداث الضائرة لعلاج الأعراض [6] ؛ مع مراعاة التأثير العلاجي الأفضل [7]. على الرغم من الطب الصيني التقليدي

Cistanche-chronickidney disease-2(80)


تم تحقيق العديد من نتائج التطبيق في علاج CRF. ومع ذلك ، بسبب الافتقار إلى توحيد المتلازمات ومرونة الوصفات الطبية ، من الصعب العثور على القواعد الأساسية ، مما أدى إلى صعوبات كبيرة في وراثة وتطوير ابتكاري لـ CRF. لذلك ، من الضروري استخدام طرق استخراج البيانات لاستكشاف قواعد الدواء للطب الصيني التقليدي في علاج CRF. أنشأت منصة دعم الميراث TCM التي طورها معهد المواد الطبية الصينية ، الأكاديمية الصينية للعلوم الطبية الصينية ، ظروفًا لاكتشاف تطور الأمراض وقوانين الأدوية ، ولها قيمة سريرية مهمة.
مستشفى Jiujiang للطب الصيني التقليدي التابع لجامعة Jiangxi للطب الصيني التقليدي هو المركز السريري الوطني لأمراض الكلى في الطب الصيني التقليدي. كبير الأطباء Wu Zhaodong هو رئيس قسم أمراض الكلى. جمع المدير Wu Zhaodong سنوات خبرته السريرية العديدة لجمع نظريات مختلفة
بشكل عام ، إنه فعال جدًا في علاج CRF. يعتقد المدير Wu Zhaodong أن التسبب في CRF يرجع أساسًا إلى نقص الطحال والكلى ، وتراكم العكارة والسموم ، وعدم توازن حركة qi. فيما يتعلق بطرق العلاج ، في الماضي ، عالج الأطباء في الغالب CRF من منظور الكلى ، لكن المدير Wu Zhaodong دعا بشكل مبتكر إلى ضرورة علاج CRF من الطحال والمعدة ، وتنشيط الطحال والكلى ، وتغذية الطبيعة المكتسبة للتغذية الفطري والتعاون مع تنظيم صعود وسقوط qi ، فإن التأثير السريري غالبًا ما يكون ضعف النتيجة بنصف الجهد. وفقًا لذلك ، تهدف هذه الدراسة إلى استخدام استراتيجيات التنقيب عن البيانات وعلم الصيدلة الشبكي استنادًا إلى بيانات حالة المرضى الخارجيين للمدير Wu Zhaodong للتنقيب في البداية عن تجربته السريرية في علاج CRF ، واستكشاف آلية تأثير الوصفة الأساسية الجديدة ، ووضع الأساس للمتابعة- يصل البحث.
 

1 المواد والأساليب
1.1 مصادر الوصفات الطبية من يوليو 2019 إلى يوليو 2021 ، تم اختيار المدير Wu Zhaodong لأول وصفات ورقية متابعة لتشخيص وعلاج CRF في مستشفى Jiujiang للطب الصيني التقليدي ، وتم فحص ما مجموعه 200 وصفة ورقية.
1.2 معايير إدراج السجلات الطبية ارجع إلى معايير التشخيص الخاصة بـ CRF في الإرشادات الأمريكية لعام 2012 لجودة تشخيص أمراض الكلى. تم اختيار المرضى الذين يعانون من المرحلة Ⅱ ~ Ⅴ ليس على غسيل الكلى. أولئك الذين يستوفون تشخيص "مرض الفشل الكلوي" في الطب الصيني التقليدي ، مع ظهور وقت أكبر من أو يساوي 6 أشهر ، وأخذ مغلي الطب الصيني التقليدي. راجع معيار حكم التأثير العلاجي [8] لتقييم العلاج على أنه "فعال".
1.3 برنامج التحليل "المنصة المساعدة للوراثة للطب الصيني التقليدي (V2.5)" يتم توفيره من قبل معهد المواد الطبية الصينية ، الأكاديمية الصينية للعلوم الطبية الصينية. يحتوي البرنامج على خوارزميات ووظائف مثل قواعد الارتباط وخوارزميات التجميع وإحصاءات التردد ، ويمكن استخدامه لإدخال وصفات الحفظ والتحليل والتعدين لممارسي الطب الصيني المشهورين وذوي الخبرة.
1.4 تحليل البيانات من خلال وظيفة تحليل الوصفات الطبية في وحدة تحليل البيانات لبرنامج منصة دعم الوراثة TCM (V2.5) ، يتم التنقيب عن قواعد الدواء ، ويتم إجراء تحليل تركيبة الأدوية عالية التردد ، ويتم الحصول على تسلسل تركيبة الوصفات الطبية الجديدة المحتملة .
1.5 تم إجراء جمع وفحص المكونات الكيميائية الرئيسية لتسلسل تركيبة الوصفات الطبية الجديدة 1 (المشار إليها فيما يلي باسم الوصفة الجديدة 1) باستخدام قاعدة البيانات ومنصة التحليل الخاصة بعلم الأدوية النظامي للطب الصيني التقليدي (TCMSP) وجزيء الطب الصيني التقليدي. أداة تحليل المعلوماتية الحيوية للآلية (http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/) تسترجع جميع المكونات الدوائية. تم اختيار أولئك الذين لديهم التوافر البيولوجي الفموي (OB) أكبر من أو يساوي 3 0 في المائة وتشابه المخدرات (DL) أكبر من أو يساوي 0.18.

Cistanche-chronickidney disease-5(83)


بالإضافة إلى ذلك ، تم أيضًا تضمين المكونات التي لم يتم تضمينها في قاعدة البيانات ولكن تم الإبلاغ عنها في الأدبيات ذات النشاط البيولوجي.

1.6 الأهداف المحتملة تطبيق قاعدة بيانات علم الأدوية وأنظمة الطب الصيني التقليدي وتحليلها
تم استرداد الجينات المستهدفة لجميع المكونات النشطة للوصفة الجديدة 1 على منصة قاعدة البيانات الخاصة بأدوات تحليل المعلومات الحيوية للآلية الجزيئية للطب الصيني التقليدي ، وتم إنشاء شبكة تفاعل العنصر النشط المستهدف من خلال برنامج Cytoscape 3.7.1 (https: / / /cytoscape.org/).

1.7 فحص هدف مرض CRF اضبط مصطلح البحث على أنه "الفشل الكلوي المزمن" ، وابحث في GeneCards وقاعدة بيانات Mendelian الوراثية البشرية على الإنترنت (OMIM ، https://www.omim.org/) ، واقصي أهداف مرض CRF ، وابحث في قاعدة بيانات UniProt (https://www.uniprot.org) تم تطبيع الأهداف التي تم فحصها بالتوازي للحصول على هوية الحماية السويسرية.

1.8 فحص الاستهداف المشترك وبناء الشبكة للمكونات النشطة للصيغة الجديدة 1 و CRF تم الحصول على الاستهداف المشترك للمكونات النشطة للصيغة الجديدة 1 و CRF باستخدام R و Perl. استخدم STRING لبناء شبكة تفاعل ذات هدف مشترك.

1.9 إنشاء شبكة هدف مكون من مكونات نشطة استخدم Cytoscape 3.7.1 دمج المكون الإضافي لإنشاء شبكة التفاعل.

1.10 علم الوجود الجيني (GO) وموسوعة كيوتو للجينات والجينوم (KEGG) تم استخدام تحليل المسار R GO.R و Perl لتحليل GO. تم إجراء تحليل مسار KEGG باستخدام حزمة KEGG.R. لتوضيح آلية التأثير البيولوجي المحتملة للصيغة الجديدة 1 في علاج CRF.

1.11 تقييم التأثير العلاجي للوصفة الجديدة 1 على فئران CRF تم أخذ فئران SD محددة خالية من مسببات الأمراض ، ورقم الشهادة SCXK (Xiang) 2021-0002 ، وتمت الموافقة على هذه الدراسة من قبل لجنة مراجعة أخلاقيات الحيوان التجريبية بجامعة Jiangxi في الطب الصيني التقليدي ، رقم JZLLSC2 0 20026. تم تقسيم الفئران في المجموعة النموذجية بشكل عشوائي إلى مجموعة فارغة ومجموعة نموذجية ، وتم تحضير نموذج CRF عن طريق استئصال الكلية 5/6. عملية محددة: تم تخدير الفئران بالإيزوفلورين ، وتم إجراء شق عمودي على العمود الفقري 1 سم على الجانب الأيسر من العمود الفقري الرئيسي و 0.5 سم على القوس الساحلي الأيسر. في ظل ظروف معقمة ، تم تشريح الكبسولة الكلوية بشكل صريح ، وتعرضت الكلية اليسرى ، وتم ربط ثلثي الشريان الكلوي الأيسر ، وتم إغلاق البطن وخياطته. بعد سبعة أيام ، تمت إزالة الكلية اليمنى. بعد 28 يومًا ، كان كرياتينين المصل ونتروجين اليوريا في الدم أعلى بكثير من تلك الموجودة في الجرذان العادية ، وكان الاختلاف ذا دلالة إحصائية ، مما يشير إلى نجاح النمذجة [9].
تم تقسيم الفئران ذات النمذجة الناجحة بشكل عشوائي إلى مجموعة نموذجية ومجموعة Xinfang 1 ، وتم إعطاء مجموعة Xinfang 1 محلول الدواء وفقًا لمجموع الجرعات السريرية المتعددة × 0. 018 × 5 ، مرة واحدة يوميًا ، لمدة 28 أيام متتالية. بعد الإعطاء ، تم أخذ المصل وإرساله إلى قسم المختبر بالمستشفى للكشف عن محتوى مصل الكرياتينين (مجموعة فحص الكرياتينين ، شركة Century World ، رقم الدفعة R39120101) ونيتروجين اليوريا في الدم (مجموعة فحص نيتروجين اليوريا ، شركة Century World Company ، رقم الدفعة 700300908). تم أخذ نسيج الكلى وتجانسه واكتشاف أكسيد النيتريك (NO ، معهد Nanjing Jiancheng للهندسة الحيوية ، رقم الدُفعة 20210605) وفقًا لتعليمات المجموعة.
سينثاس أكسيد النيتريك البطاني (NOS) 3 (Shanghai Zeye Biotechnology Co.، Ltd. ، رقم الدُفعة 20210805).

Cistanche-chronickidney disease-6(84)

نتيجة
2.1 هناك 217 دواء صيني تقليدي في أول وصفة طبية من 200 وصفة طبية ، و 22 دواء تستخدم أكثر من 40 مرة. أفضل 3 أدوية هي Astragalus و Liuyuexue و Smilax smilax. انظر الجدول 1.

news-859-738

2.2 تحليل انتظام الوصفات بناءً على تحليل قاعدة الارتباط وفقًا لتكرار حدوث التوليفات الدوائية ، فإن المراكز الثلاثة الأولى هي "Smilax ، Liuyuexue" ، "Astragalus ، Liuyuexue" و "Smilax ، Astragalus". انظر الجدول 2. تم تحليل قواعد الدواء لأزواج الأدوية التي تم الحصول عليها ، وتظهر النتائج في الجدول 3. وترد شبكة قياس الارتباط في الشكل 1.

news-678-744

2.3 تحليل قانون الوصفات الطبية على أساس تجميع الانتروبيا
2.3.1 The correlation degree analysis between drugs based on the improved mutual information method is based on the number of prescriptions, combined with experience judgment and pre-reading of data extracted from different parameters, setting the correlation degree to 6, the penalty degree to 2, and performing cluster analysis to obtain the For the degree of correlation between any two drugs, list the drug pairs with a correlation coefficient >0 05. انظر الجدول 4.

2.3.2 تحليل الوصفات الجديدة على أساس المجموعات الهرمية غير الخاضعة للرقابة على أساس الاستخراج الأساسي أعلاه ، تم الحصول على 8 وصفات جديدة باستخدام خوارزمية التجميع الهرمي غير الخاضعة للرقابة ، كما هو موضح في الجدول 5. انظر الشكل 2 للحصول على الدواء المركب الأساسي شبكة الوصفات الطبية الجديدة وشبكة الأدوية الوصفة الجديدة.

2.4 فحص المكونات النشطة للوصفة الجديدة 1 من خلال قاعدة البيانات المذكورة أعلاه ، تم استرداد المكونات النشطة لتسلسل تركيبة الوصفات الطبية الجديدة 1 ، وتظهر النتائج في الجدول 6.

 

2.5 جمع وفحص المكونات النشطة في الصيغة الجديدة {2}} تم الحصول على المكونات النشطة بيولوجيًا ، بإجمالي 37 هدفًا (بدون تكرار) ، من بينها المكونات الرئيسية ذات التصنيف الأعلى - سيتوستيرول ، وستيغماستيرول ، وما إلى ذلك. المكونات المقابلة والأهداف ، وجد أن أحد المكونات النشطة يمكن أن يعمل على أهداف متعددة ، مثل -سيتوستيرول يمكن أن يتوافق مع أهداف إنترلوكين (IL) -6 ، وعامل نمو بطانة الأوعية الدموية A (VEGFA) ، وحمض السيستين ، وحمض الأسبارتيك ، إنزيم محلل البروتين (Caspase) -3 ، NOS3 ، العامل المحرض لنقص الأكسجة (HIF) -1 ، PON1 ، NR3C2 ؛ يمكن أن تعمل المكونات النشطة المتعددة أيضًا على هدف واحد معًا ، مثل -sitosterol و Stigmasterol و Isorhamnetin و Quercetin و Kaempferol
يمكن أن تتوافق مع الهدف NOS3 ؛ تم التأكيد على أن Xinfang 1 يلعب دورًا شاملاً بأهداف متعددة ومسارات متعددة.

news-348-743
قد يعجبك ايضا