الـ PARPs المستحثة بالإنترفيرون — أجهزة استشعار للأحماض النووية الأجنبية؟

خلاصة: طورت الخلايا استراتيجيات مختلفة للتعامل مع الالتهابات الفيروسية. إن مفتاح بدء الاستجابة الدفاعية ضد الفيروسات هو القدرة على تمييز الجزيئات الأجنبية عن جزيئاتها. إحدى الآليات المركزية هي إدراك الأحماض النووية الأجنبية بواسطة البروتينات المضيفة والتي بدورها تبدأ استجابة مناعية فعالة. لقد تطورت مستقبلات التعرف على أنماط استشعار الحمض النووي، حيث يستهدف كل منها ميزات محددة لتمييز الفيروس عن الحمض النووي الريبي (RNA) المضيف. يتم استكمالها بالعديد من البروتينات المرتبطة بالـ RNA والتي تساعد في استشعار RNAs الأجنبية. هناك أدلة متزايدة على أن ناقلات ADP-ribosyltransferase المحفزة للإنترفيرون (ARTs؛ PARP9 — PARP15) تساهم في الدفاع المناعي وتخفيف الفيروسات. ومع ذلك، فإن تفعيلها والأهداف اللاحقة والآليات الدقيقة للتدخل في الفيروسات وانتشارها لا تزال مجهولة إلى حد كبير. يشتهر بأنشطته المضادة للفيروسات ودوره كمستشعر للحمض النووي الريبوزي (RNA) وهو PARP13. بالإضافة إلى ذلك، تم وصف PARP9 مؤخرًا على أنه مستشعر للحمض النووي الريبي الفيروسي. سنناقش هنا النتائج الحديثة التي تشير إلى أن بعض PARPs تعمل في المناعة الفطرية المضادة للفيروسات. نحن نتوسع في هذه النتائج وندمج هذه المعلومات في مفهوم يوضح كيفية عمل PARPs المختلفة كأجهزة استشعار للحمض النووي الريبي الأجنبي. نحن نتكهن بالعواقب المحتملة لربط الحمض النووي الريبي (RNA) فيما يتعلق بالأنشطة التحفيزية لـ PARPs، وخصوصية الركيزة، والإشارات، والتي تؤدي معًا إلى أنشطة مضادة للفيروسات.

فوائد مكملات cistanche - زيادة المناعة

الكلمات الرئيسية: ADP-الريبوسيل. MARylation؛ هيدرولاز. مضاد للفيروسات. المجال الكلي؛ بارب؛ فيروس الحمض النووي الريبي

ماذا يفعل عشب سيستانش – مضاد-التهابي

1 المقدمة

من أجل إنشاء استجابة مناعية فطرية للفيروسات الغازية، يجب أن تكون الخلايا قادرة على تمييز نفسها عن الخلايا الغريبة. ويتم تحقيق ذلك جزئيًا من خلال مجموعة من البروتينات التي تستشعر على وجه التحديد الأحماض النووية الأجنبية. تنتمي هذه البروتينات إلى ما يسمى بمستقبلات التعرف على الأنماط (PRRs) التي تتعرف وتربط الأنماط الجزيئية المرتبطة بمسببات الأمراض (PAMPs)، بما في ذلك الأحماض النووية المختلفة المرتبطة بمسببات الأمراض [1-3]. بشكل عام، عند ربط PAMP، يتم تنشيط هذه الـ PRRs لتحفيز أحداث الإشارة النهائية عبر تنشيط عوامل النسخ، مثل عوامل تنظيم الإنترفيرون 3 و7 (IRF3، IRF7) والعامل النووي kappa B (NF-κB). وينتج عن ذلك تنشيط برنامج التعبير الجيني، والذي يتضمن تحفيز الإنترفيرون (IFN) بالإضافة إلى جينات السيتوكينات الأخرى. تعمل الإنترفيرون بطريقة نظيرة صماء واستبدادية للحث على التعبير عن الجينات المحفزة بالإنترفيرون (ISGs) والتي يتم من خلالها تعزيز الحالة المضادة للمرض [1،3]. يمكن تقسيم أجهزة استشعار PRR لاستشعار الحمض النووي إلى مجموعتين، المقصورة المستخدمة، وأجهزة الاستشعار الاندوسومالية والحمض النووي الخلوي. تنتمي مجموعة فرعية من مستقبلات Toll-like (TLRs) إلى المجموعة الفرعية الأولى، في حين تشتمل المجموعة الثانية على مستقبلات تشبه الجين I (RIG-I) المحفز لحمض الريتينويك (RLRs)، بروتين كيناز R (PKR)، 20-50 أوليجوادينيلات. بروتينات سينثيتاز (OAS 1-3)، ومستقبلات تشبه مجال احتكار القلة المرتبطة بالنيوكليوتيدات (NOD) (NLRs)، غائبة في المستقبلات الشبيهة بسرطان الجلد 2 (AIM2) (ALRs) وسينسيز GMP-AMP الدوري (cGAS) [2 ،4-10]. بالإضافة إلى هذه PRRs الكلاسيكية، تم وصف قائمة متزايدة من بروتينات مستشعر الحمض النووي أو البروتينات الملحقة. وتشمل هذه طائرات الهليكوبتر، وأربطة اليوبيكويتين، وناقلات الريبوسيلت ADP، التي يمكنها استشعار بعض الأحماض النووية، أو المساعدة في التعرف على الأحماض النووية الأجنبية، أو التوسط فيها، وتسريع الإشارات النهائية وبالتالي المساهمة في الاستجابة المناعية المضادة للفيروسات وتعديلها [11-15]. يشتهر بأنشطة ربط الحمض الريبي النووي الفيروسي (RNA) بـ PARP13 [11]. بالإضافة إلى ذلك، تم التعرف مؤخرًا على PARP9 باعتباره مستشعرًا للحمض النووي الريبي (RNA) الأجنبي [15]. بالنسبة لـ PARP13، يتم تسهيل ربط الحمض النووي الريبي (RNA) عن طريق مجالات إصبع الزنك، بينما بالنسبة لـ PARP9، تم تحديد المجال الكبير باعتباره وحدة ربط الحمض النووي الريبي (RNA) الفيروسية. ينتمي PARP9 وPARP13 إلى عائلة ثنائي فوسفات الأدينوساين (ADP) - ريبوسيلترانسفيراز الشبيه بسم الخناق (ARTD)، والتي تم ربط مجموعة فرعية صغيرة من البروتينات منها بالمناعة الفطرية بسبب استجابتها للـ IFNs (لمزيد من القراءة عن PARPs كـ ISGs نحن الرجوع إلى مراجعة ممتازة الأخيرة [16]). تشترك هذه البروتينات في مجال ADP-ribosyltransferase (ART) المحفوظ، والذي، باستثناء PARP13، يمتلك نشاط أحادي ADP-ribosylation (MARylation). تتميز كل هذه الـ PARPs بمجموعة من مجالات البروتين الإضافية، من بينها المجالات الكبيرة، أو مجالات التعرف على الحمض النووي الريبي (RNA)، أو أصابع الزنك. على الرغم من أن وظائف هذه المجالات المرتبطة غير معروفة إلى حد كبير، فقد ارتبط العديد منها بربط الحمض النووي الريبي (RNA). وبالتالي، فهي توفر لهذه البروتينات القدرة المحتملة على العمل كأجهزة استشعار للحمض النووي الريبوزي (RNA) مماثلة لما تم اقتراحه لـ PARP9 وPARP13 [11،15]. معًا، نفترض أن PARPs المحفزة لـ IFN تعمل كـ PRRs لاستشعار RNA وتوسع طرائق ربط RNA الخاصة بـ PRRs الكلاسيكية المعروفة فيما يتعلق بالتسلسل و / أو خصائص البنية. علاوة على ذلك، فإن ربط الحمض النووي الريبي (RNA) قد ينظم أنماط عملها ووظائفها.

2. مستقبلات التعرف على مسببات الأمراض الكلاسيكية

2.1. PRRs مجزأة

المستقبلات الشبيهة بالحصيلة المشاركة في استشعار الأحماض النووية المسببة للأمراض هي TLR3 وTLR7- 9 [4،17–19]. تم دمج TLRs هذه في أغشية الإندوسومات مع المجال الخارجي المرتبط بالحمض النووي N- الطرفي الذي يواجه الجزء الداخلي من هذه الحويصلات [4،17،18]. يؤدي ربط الحمض النووي إلى تقليص حجم TLRs، حيث تبدأ عمليات الإشارة المتنوعة [4]. نظرًا لتوطينها، فإن هذه المستقبلات TLRs قادرة على الاستجابة لمسببات الأمراض الملموسة أو المبتلعة التي قد يتم تفكيكها في هذه الحجرة من خلال عمل البروتياز الاندوسومي والنوكلياز. ونتيجة لذلك، تتم معالجة الحمض النووي الريبي (RNA) المشتق من مسببات الأمراض أو الحمض النووي الريبي منقوص الأكسجين (DNA) وكشفه، مما يوفر PAMPs التي يمكن أن تتفاعل مع TLRs الاندوسومية [18]. يؤدي هذا إلى بدء الموجة الأولى من الإشارات المضادة للفيروسات [4،18،19]. ولتغطية التعرف على مجموعة واسعة من مسببات الأمراض المختلفة، طورت TLRs هذه تفضيلات مختلفة للأحماض النووية [4،18،19]. يتعرف TLR3 على أنواع الحمض النووي الريبي (RNA) المزدوجة الجديلة ويربطها بناءً على التفاعلات الكهروستاتيكية بين الأحماض الأمينية المشحونة إيجابياً كجزء من التكرارات الغنية بالليوسين في المجال الخارجي والعمود الفقري للريبوز والفوسفات المشحون سالبًا في الحمض النووي الريبي (RNA). يحدث الارتباط بشكل مستقل عن تسلسلات محددة من الحمض النووي الريبي (RNA) [19]. في الآونة الأخيرة، تم إثبات تنشيطه بواسطة هجينة RNA-DNA الخلوية المشتقة من حلقة R، مما يثير إشارات مناعية لاحقة مما أدى إلى تنشيط IRF3 [20]. ومع ذلك، فإن كيفية تنظيم معالجة حلقة R وكيف تصل هذه الهجينة، التي تم إنشاؤها في الأصل في النواة، إلى العصارة الخلوية أو حتى تكون قادرة على تنشيط هذا المستقبل الإندوسومي، لا تزال غير واضحة. تجدر الإشارة إلى أنه تم أيضًا تحديد تسلسلات تشكيل R-Loop بين الفيروسات، ولكن ما إذا كانت هذه بالفعل تشكل هياكل R-Loop وتكون قادرة على تحفيز تنشيط TLR3 يحتاج إلى دراسة [21]. TLR7 وTLR8، المرتبطان ارتباطًا وثيقًا، يستشعران منتجات انهيار الحمض النووي الريبي (RNA) والحمض النووي الريبي (RNA) المفرد الذين تقطعت بهم السبل. يحتوي كل من TLR7 وTLR8 على نموذجين مرتبطين بالحمض النووي الريبي (RNA)، حيث يتعرف الأول على الغوانوزين الفردي أو اليوريدين، على التوالي، في حين ثبت أن الثاني يتوسط في بعض خصوصية التسلسل. يرتبط TLR7 بشكل تفضيلي بـ polyU 3-mers، بينما يستشعر TLR8 قليلات النوكليوتيدات UG/UUG [22،23]. في المقابل، ثبت أن TLR9 يرتبط بالحمض النووي المفرد الذي يحتوي على نموذج CpG [4،18].

فوائد ملحق cistanche-كيفية تقوية جهاز المناعة

2.2. PRRs عصاري خلوي

أجهزة الاستشعار الرئيسية للأحماض النووية الفيروسية في العصارة الخلوية، الموجودة عند الإصابة بالفيروس، هي RLRs [2،7،24]. العضو المسمى لهذه المستقبلات العصارية الخلوية هو RIG-I. ومن بين الأعضاء الإضافيين الجين 5 لرابطة تمايز سرطان الجلد (MDA5) ومختبر علم الوراثة وعلم وظائف الأعضاء 2 (LGP2). تشترك جميع البروتينات الثلاثة في تنظيم مجال مماثل مع مجال RNA-helicase المركزي الذي يتوسط بالتنسيق مع مجال الطرف C (CTD) ربط RNA [2،7،24]. على النقيض من LGP2، يتشارك RIG-I وMDA5 في مجالي تنشيط وتوظيف caspase (CARDs) عند طرفهم N الذي يؤدي إلى أحداث إشارات المصب [2،7]. في حالة RIG-I، ترتبط بطاقات CARD هذه داخل الجزيئات بمجال الهليكاز وCTD، مما يؤدي إلى تكوين مغلق للبروتين وبالتالي منع الإشارة النهائية في حالة عدم وجود يجند [7،25]. يستلزم التعرف على الحمض النووي التحلل المائي لـ ATP بواسطة RIG-I ويثير التغيير إلى التشكل المفتوح واحتكاره. يسمح هذا بتفاعل أوثق للجزء المرتبط بالـ RNA مع الأحماض النووية بينما يتم إطلاق بطاقات CARD للتفاعل مع متفاعل الميتوكوندريا لإشارات الفيروس (MAVS) لنقل الإشارة النهائية [7،24]. حالة التثبيط الذاتي الموضحة لـ RIG-I لا تحدث لـ MDA5. وبدلاً من ذلك، يظهر MDA5 شكلاً مفتوحًا ومرنًا وبالتالي غير مقيد. وهذا يستلزم الإشارة إلى المصب عند الإفراط في التعبير عن MDA5 في غياب يجند RNA [26-28]. نظرًا لعدم وجود بطاقات CARD، لا يمكن لـ LGP2 بدء إرسال الإشارات النهائية مباشرة عبر MAVS. ولكن يبدو أنه يعمل كمعدِّل لإشارات MDA5. عند مستويات البروتين المنخفضة، يعمل LGP2 على تسريع واستقرار تفاعل MDA5-RNA، في حين تؤدي المستويات العالية من LGP2 إلى تثبيط MDA5 [27,29,30]. بالنسبة لجميع أفراد الأسرة الثلاثة، يتم تسهيل التعرف على الأحماض النووية من خلال مجال الهليكاز المركزي وCTD [2،7،24]. تسهل مجالات البروتين هذه مسح السمات البيوكيميائية الموجودة في الطرف الخمسين لجزيئات الحمض النووي الريبي (RNA). على الرغم من مشاركة نطاقات الهيليكاز وCTDs القابلة للمقارنة، فإن RIG-I وMDA5 يشعران بميزات مختلفة قليلاً داخل RNAs [31]. يفضل RIG-I RNAs الأقصر المزدوج (ds) أو ssRNA ويتم تنشيطه بواسطة 5 0 -PPP-dsRNA أو 50 -pp-dsRNA، في حين يظل 50 RNA أحادي الفسفرة غير مكتشف بواسطة RIG-I [32]. علاوة على ذلك، يتم التعرف على RNA المخصب في مناطق poly-U/UC أو AU بالإضافة إلى RNA الفيروسي الدائري بواسطة RIG-I [33-35]. يُقترح أن يتم الارتباط بالـ RNA الدائرية من خلال السمات الهيكلية للـ RNA أو من خلال بروتينات ربط RNA الإضافية، والتي تحتاج إلى تحديد [33]. يرتبط MDA5 بشكل تفضيلي بالـ dsRNAs الطويلة والمناطق الغنية بالاتحاد الأفريقي [28،36،37]. لقد ثبت أن LGP2 قادر على اكتشاف مجموعة واسعة من RNAs المتنوعة. لا يبدو أن حالة الفسفرة للنهاية 50- ولا طول الحمض النووي الريبي (RNA) تؤثر على التعرف والربط بواسطة LGP2 [38,39]. ومن المعروف أيضًا أن استشعار الحمض النووي الريبي (RNA) بواسطة بروتينات عائلة PKR أو OAS 1-3 يساهم في الاستجابة الدفاعية المضادة للفيروسات [9،10]. يتعرف PKR على جزيئات الرنا المزدوج الجديلة الأطول من 30 نقطة أساس بطريقة مستقلة عن الحد الأقصى [40]، ولكن تم وصف ssRNA والارتباط المنظم 5'-PPP-RNA [41،42]. يتم تسهيل الربط من خلال مجالين مرتبطين بالحمض النووي الريبي (RNA) ترادفيًا يقعان في النصف الطرفي N الخاص به، والذي عند ربط الحمض النووي الريبي (RNA) يبدأ تقليص حجم PKR وتنشيط الكيناز اللاحق [43]. ربط OAS 1-3 بـ dsRNA [10،44–46]. بناءً على ربط الرنا المزدوج الجديلة، تقوم OAS 1-3 بتوليف 20 -50 أوليجوادينيلات مرتبطة بالفوسفوديستر، والتي تعمل كرسول ثانٍ لتحفيز عملية التقليص وبالتالي تنشيط Ribonuclease (RNase) L وبالتالي انقسام الحمض النووي الريبي (RNA) [10،47]. تعمل شظايا الحمض النووي الريبي (RNA) المشقوقة على تضخيم الإشارات المضادة للفيروسات حيث يتم استشعارها بواسطة PRRs [9]. يتم عرض خط إضافي للدفاع المناعي بواسطة NLRs وALRs [1،6،48]. عند التنشيط، ثبت أن بعض NLRs وALRs تبدأ في تجميع ما يسمى بالالتهابات، وهي مجمعات إنزيمية متعددة البروتينات التي تتجزأ فيها قليلًا وترتبط بالبروتين الشبيه بالبقع المرتبطة بموت الخلايا المبرمج والذي يحتوي على مجالات CARD (ASC) للتوسط في تنشيط التحلل البروتيني للكاسبيز. -1. وهذا بدوره يتيح نضوج السيتوكينات مثل Interleukin 1 (IL-1 ) وIL-18، وبالتالي المساهمة في الاستجابة المناعية المضادة للفيروسات. من بين NLRs، تبين أن NLRP3 يتم تنشيطه من خلال مجموعة واسعة من RNAs المتنوعة [8،49]. ومع ذلك، لم يتم إثبات التفاعل المباشر مع RNAs. بدلاً من ذلك، يتجمع NLRP3 مع بروتينات ملحقة، من بينها مروحيات DExD/H-box RNA أو TRIM ubiquitin ligases، والتي ثبت أنها تمكّن استشعار الحمض النووي الريبي (RNA) ومن ثم تنشيط الجسيم الالتهابي [8،49]. وعلى النقيض من NLRP3، يتم تنشيط AIM2 كممثل لـ ALRs بواسطة الحمض النووي [6،48،50].

بالإضافة إلى AIM2، يعمل cGAS كجهاز استشعار عصاري خلوي للحمض النووي [5]. يحدث التنشيط الكامل لـ cGAS عند الارتباط بجزيئات DNA الأطول. هذه تسمح بتقليل حجم cGAS، وهو شرط أساسي للتنشيط الكامل. ومع ذلك، فقد ثبت أن cGAS يتعرف على مجموعة متنوعة من جزيئات الحمض النووي، من بينها dsDNA، وssDNA الذي يوفر هياكل ثانوية تؤدي إلى dsDNA، أو هجينة RNA-DNA (على سبيل المثال، المستمدة من حلقات R). عند الارتباط، يتم نشر الإشارة من خلال تنشيط مُحفز جينات الإنترفيرون (STING) بوساطة cGAMP، مما يؤدي إلى تنشيط IRF3 [5]. وبالتالي، يمكن تنشيط cGAS عن طريق الحمض النووي المسبب للأمراض ولكن أيضًا عن طريق الحمض النووي الخلوي، على سبيل المثال استجابة للحمض النووي الخلوي نتيجة سوء تصنيف الكروموسومات والنوى الصغيرة وتحطم الحمض النووي [51]. إلى جانب هذه PRRs الكلاسيكية، تم تحديد العديد من العوامل المضيفة الإضافية التي تعمل كأجهزة استشعار للأحماض النووية الأجنبية، من بينها طائرات الهليكوبتر المربعة DExD / H، وأربطة اليوبيكويتين لعائلة الحافز الثلاثي (TRIM)، وعدد متزايد من بروتينات ربط الحمض النووي الريبي (RNA) الإضافية المختلفة [12- 14،52،53]. أيضًا، فإن عائلة المستقبلات الزبالة غير المتجانسة للغاية متورطة في المناعة الفطرية وقد ثبت أن بعض الأعضاء يرتبطون بالأحماض النووية الأجنبية [54]. بالنسبة لبعض هذه البروتينات المرتبطة بالحمض النووي الريبوزي (RNA)، فإن وظيفة السقالات متورطة [3،5،12]. إنهم يستشعرون ويربطون الحمض النووي الريبي (RNA) الغريب، ويقدمونه إلى RLRs، وبالتالي يساهمون في الإشارات المضادة للفيروسات ويضخمونها [3،5،12].

فوائد سيستانش للرجال - تقوية جهاز المناعة

انقر هنا لعرض منتجات Cistanche Enhance Immunity

【اطلب المزيد】 البريد الإلكتروني: cindy.xue@wecistanche.com / تطبيق Whats: 0086 18599088692 / Wechat: 18599088692

3. PARP13 – مستشعر الحمض النووي الريبي الفيروسي

أحد بروتينات السقالات المشار إليها أعلاه، والتي تشارك في الاستجابة المناعية الفطرية، هو بروتين إصبع الزنك المضاد للفيروسات (ZAP)، المعروف أيضًا باسم PARP13 (الشكل 1). على الرغم من أنه لا يمتلك نشاطًا تحفيزيًا، إلا أنه معروف بنشاطه الفعال المضاد للفيروسات [11]. يوجد PARP13 في أربعة أشكال إسوية مختلفة، تنشأ من الربط البديل وتعدد الأدينيلات [11،16]. أفضل اثنين من الأشكال الإسوية المدروسة هما PARP13.1 (ZAPL) وPARP13.2 (ZAPS)، والأخير يفتقر إلى المجال المشابه لـ PARP [11]. بينما يبدو أن PARP13.1 تم التعبير عنه بشكل أساسي، يتم تحفيز PARP13.2 بناءً على إشارات الإنترفيرون [55]. تم وصف التفاعل مع المناطق الثلاثين غير المترجمة (30 UTR) من RNA interferon messenger (mRNA) لـ PARP13.2، والذي يعتبر لذلك متورطًا في استجابة ردود الفعل السلبية لإشارة IFN [55]. ومن المثير للاهتمام، أنه تم العثور على PARP13.2 متحدًا مع RIG-I عند تحفيزه باستخدام 50 - RNA-PPP المزدوج الذي تقطعت به السبل (dsRNA) ويبدو أنه يلعب دورًا في تعزيز إنتاج الإنترفيرون [56]. تحتوي جميع الأشكال الإسوية لـ PARP13 على مجال ربط RNA (RBD) يتكون من أربعة أشكال لأصابع الزنك CH (ZnF)، والثاني منها معروف بجيب الارتباط الكاره للماء مع تقارب عالٍ لثنائي النوكليوتيدات CpG [11،57]. تعرض ZnFs الأخرى تقاربًا ضعيفًا للحمض النووي الريبي ذي التسلسلات غير المعروفة [11]. PARP13 قادر على تقليص حجم PARP13، وقد تم اقتراح تعدد تعدد PARP13 على الحمض النووي الريبي (RNA) المستهدف للدفاع الفعال ضد مسببات الأمراض [11]. في الآونة الأخيرة، حددت شاشة تفاعل الحمض النووي الريبوزي (RNA) لمتلازمة الجهاز التنفسي الحادة الوخيمة من النوع 2 (SARS-CoV-2) PARP13، بالإضافة إلى العامل المساعد TRIM25، للارتباط مباشرة بالحمض النووي الريبي الفيروسي [58]. بعد التعبير خارج الرحم عن PARP13.1 وPARP13.2، يبدو أن PARP13.2 وليس PARP13.1 له تأثير مضاد للفيروسات، كما يتضح من الانخفاض الكبير في البروتين غير الهيكلي SARS-CoV-2 12 (nsP12). مستويات الحمض النووي الريبي (RNA)، التي تشفر بوليميريز الحمض النووي الريبي المعتمد على الحمض النووي الريبي (RNA) الفيروسي [58]. في المقابل، أبلغ نتشيوا وزملاؤه عن انخفاض في تراكم الحمض النووي الريبي (RNA) كامل الطول لـ SARS-CoV-2 فقط في تجارب PARP13.1 ذات الدقة الزائدة [59]. ومع ذلك، بالنسبة لكلا الشكلين الإسويين، لوحظ انخفاض في مستويات الحمض النووي الريبي (RNA) لـ SARS-CoV-2 ارتفاع هيكلي وبروتين القفيصة النووية [59]. قد تكون الاختلافات في التوطين الخلوي مسؤولة عن هذه النتائج، حيث أن PARP13.2 له توزيع سيتوبلازمي منتشر، في حين أن PARP13.1 يمكن أن يكون S-farnesylated، مما يحوله إلى الجسيمات الداخلية أو الشبكة الإندوبلازمية (ER) [11]. يشكل SARS-CoV-2 حويصلات ذات غشاء مزدوج مشتقة من ER للتكاثر [60]. في الواقع، تم إثبات لاحقًا أن S-farnesylation لـ PARP13.1 ضروري لتوهين SARS-CoV-2 [61]. كما تم وصف النشاط المضاد للفيروسات ضد فيروس الأنفلونزا A (IAV). في حين يبدو أن PARP13.1 يعدل تعبير البروتين الفيروسي، فقد تم وصف PARP13.2 لاستهداف IAV RNA مباشرة [11،62]. أفاد ليو وزملاؤه أن PARP13.1 يعزز الريبوزيل متعدد ADP (PARylation) لبروتينات بوليميريز IAV، مما يؤدي إلى انتشارها وتدهورها لاحقًا [62].

ومع ذلك، بما أن PARP13 لم يتم الإبلاغ عن أي نشاط حفاز له، فيجب مشاركة بروتين ADP-ribosylating آخر في هذه العملية. إن الشكل الأقصر، PARP13.2، قادر على الارتباط بـ IAV بوليميريز RNA الأساسي 2 (PB2) mRNA ويؤدي إلى تدهوره وكذلك منع ترجمته [63]. يتم التصدي لهذه العملية بواسطة بروتين البروتين غير البنيوي 1 (NS1) الموجود في IAV، والذي وجد أنه يمنع ربط الحمض النووي الريبي الفيروسي بواسطة PARP13.2 [63]. ومن المثير للاهتمام أيضًا أن NS1 mRNA يبدو أنه لا يتأثر بـ PARP13.2 [63]. من المحتمل أن يعزى ذلك إلى الهياكل الثانوية داخل NS1 RNA، والتي ثبت أنها تشكل دبابيس شعر مما يؤدي إلى أن تكون أجزاء كبيرة من هذا الحمض النووي الريبي (RNA) مزدوجة الجديلة [64]. جنس آخر من الفيروسات المقيدة بواسطة PARP13 هي فيروسات ألفا مثل فيروس Sindbis، الذي يستهدفه PARP13.1 في حبيبات الإجهاد (SGs) [55]. في الآونة الأخيرة، وجدت مجموعات مختلفة في تجارب البلورة أن جيب WWE2 لـ PARP13 قادر على الارتباط بجزء ADP-ribose (ADPr) من سلاسل poly-ADP-ribose (PAR) [65،66]. كما أكد شيويه وزملاؤه هذه النتائج في المختبر، وكشفوا عن دور أساسي لاثنين من الأحماض الأمينية في مجال WWE2، W611 وQ668، في هذا الارتباط. علاوة على ذلك، فقد أثبتوا أن ZnF5 وWWE1 وWWE2 لـ PARP13 تتحد لتشكل مجالًا أطلقوا عليه اسم المجال المركزي (CD) وأن هذا القرص المضغوط يرتبط بـ PAR في الخلايا. وقد تبين أيضًا أن الشكل الإسوي الطويل لـ PARP13، PARP13.1، يربط PAR في الخلايا، على الرغم من أنه ليس بكفاءة القرص المضغوط المعزول [66]. يلعب هذا الارتباط دورًا مهمًا في حبيبات الإجهاد (SGs)، حيث يعد ربط PAR شرطًا أساسيًا لإعادة توطين PARP13-CD وPARP13.1 [66]. بالإضافة إلى ذلك، وجد أن الخلل الطفري لـ PARP13.1 المرتبط بـ PAR يخفف من نشاطه المضاد للفيروسات [66]. تم أيضًا وصف التعريب لحبيبات الإجهاد لـ PARP13.2، والذي يتم تجزئته بشكل متزايد عند الإجهاد [67]. وبالتالي، تسمح حبيبات الإجهاد (SGs) بتراكم الحمض النووي الريبي (RNA)، وPAR، وPARP13 [66،68]. ما إذا كان التجميع يساهم في النشاط المضاد للفيروسات لـ PARP13، أي تعزيز تدهور الحمض النووي الريبي (RNA) أو تثبيط الترجمة. تجدر الإشارة إلى أنه على غرار بروتينات PARP13 الإضافية، فقد ثبت أنها ترتبط بـ SGs، مما يشير إلى عمل منسق أو دور تآزري لـ PARPs في تكوين و/أو وظيفة SG. تشير النتيجة إلى اتجاه مماثل، وهو أن PARP13، على الرغم من افتقاره إلى النشاط التحفيزي نفسه، إلا أنه يحتوي على ريبوسيلات ADP وبالتالي يجب أن يتفاعل بشكل وثيق مع إنزيمات PARP الأخرى [67]. قد يتحكم الريبوسيل ADP هذا في وظيفة PARP13 كما هو موضح على سبيل المثال في PARP7، الذي يتحلل بقايا السيستين في ZnFs، وبالتالي يتداخل مع قدرة PARP13 على التفاعل مع RNA [16]. نتوقع العديد من التفاعلات الإضافية بين بروتينات PARP بالإضافة إلى PRRs الأخرى والمؤثرات النهائية. وبالتالي، فإن كيفية تضافر PARPs للتعرف الفعال على الأحماض النووية والدفاع ضد مسببات الأمراض هي أسئلة مثيرة في مجال الدفاع المناعي الفطري.

4. الفئة الفرعية التي تنظمها IFN من PARPs

4.1. عائلة بارب

استنادًا إلى تنظيم المجال والتحليل الهيكلي، تم تعيين PARP13 لعائلة ADP-ribosyltransferases الشبيهة بسموم الخناق (ARTDs)، والتي تضم في المجموع 17 عضوًا [69-71]. تشترك جميعها في مجال ART محفوظ للغاية، والذي، باستثناء PARP13، يمكّن هذه البروتينات من تحفيز ريبوسيليز ADP. ADP-ribosylation هو تعديل ما بعد الترجمة قابل للعكس (PTM)، والذي يتميز بإضافة واحد أو أكثر من شظايا ADP-ribose على الركيزة [70]. استنادًا جزئيًا إلى تركيبة الأحماض الأمينية للثالوث التحفيزي، يمكن للإنزيمات الفردية إما تحفيز PARylation (PARP1 وPARP2 وTNKS1 وTNKS2) أو MARylation (PARP3 وPARP4 وPARP7-PARP12 وPARP14-PARP16 ) [70،72]. للقيام بذلك، فإنها تستهلك النيكوتيناميد الأدينين ثنائي النوكليوتيد (NAD +) كعامل مساعد ونقل ADP-ribose، إما شاردة واحدة (MARylation) أو في عملية تكرارية (PARylation) وحدات متعددة مع إطلاق النيكوتيناميد [70]. PARP13 هو الفرد الوحيد في العائلة الذي يفتقر إلى نشاط ADP-ribosylation بسبب عدم قدرته على ربط NAD + بشكل صحيح [73]. في ما يلي، سوف نركز على PARPs المستجيبة للفيروسات (PARP9-15؛ الشكل 1) [16]، MARylation، وقدرات استشعار الحمض النووي (المحتملة) لهذه المجموعة الفرعية من PARPs.

4.2. تنظيم ونشر MARylation

مثل أجهزة PTMs الأخرى، يجب قراءة MARylation ونشر الإشارة. تم تحديد المجالات الكبيرة 2 و 3 لـ PARP14 كقراء لـ MARylation [70،74،75]. علاوة على ذلك، يعرض MARylation PTM قابل للعكس تمامًا وممكن من خلال النشاط المائي الذي تمتلكه بعض المجالات الكبيرة [70]. تتضمن المحايات الخلوية لـ MARylation MacroD1، وMacroD2، وTARG1. يتم تمكين إلغاء MARylation من خلال المجال الكلي النشط [70]. يتم الحفاظ على طية المجال الكبير بشكل كبير بين جميع أنواع الحياة وهي مدمجة في البروتينات غير الهيكلية للعديد من فيروسات الحمض النووي الريبي ((+) ss) ذات المعنى الإيجابي أيضًا [16،76،77]. يشير تحريض MARylating PARPs بواسطة نظام IFN الفطري مع قدرة العديد من المجالات الكبيرة الفيروسية على عكس MARylation إلى دور مضاد للفيروسات لـ PARPs المحفزة لـ IFN. علاوة على ذلك، فقد ثبت أن PARPs تطورت في ظل اختيار إيجابي قوي، مما يشير بالإضافة إلى ذلك إلى وظيفة في المناعة الفطرية [78،79]. ومع ذلك، فإن الأفكار حول الآليات والوظيفة الدقيقة لـ PARPs المحفزة للإنترفيرون تظل بعيدة المنال. أحد الاحتمالات التي قد تساهم بها الـ PARPs المحفزة للإنترفيرون في الاستجابة المضادة للفيروسات هو التعرف على الأحماض النووية الأجنبية. كما هو موضح من قبل، يمكن أن تكون البروتينات المحولة مثل طائرات الهليكوبتر المربعة DExD/H أو PARP13 بمثابة سقالات تجمع الأحماض النووية والبروتينات المستجيبة على مقربة. وبالمثل، يمكن لـ PARPs المستجيبة لـ IFN أن تعمل كسقالات وبالتالي تساعد في التعرف على الحمض النووي الريبي (RNA) بواسطة أحد PRRs الكلاسيكية. علاوة على ذلك، يمكن لنشاط MARylation الخاص بهم أن يضيف مستوى آخر من التنظيم لضبط الاستجابة المناعية الفطرية. هناك دلائل تشير إلى أن وجود الحمض النووي الريبي الفيروسي قد يؤدي إلى نشاط MARylation لهذه الإنزيمات [80،81]. بافتراض أن ربط الحمض النووي الريبي (RNA) يحدد النشاط التحفيزي، فقد يسمح أيضًا بإعادة توجيه النشاط التحفيزي إلى ركائز متميزة. يمكن أن تكون هذه عوامل فيروسية ومضيفة. علاوة على ذلك، قد تؤثر الخصوصية المتغيرة أيضًا على استقرار البروتين، على سبيل المثال عن طريق تقليل التعديل التلقائي، وبالتالي منح استقرار بعض إنزيمات PARP [82]. بالإضافة إلى ذلك، قد يمثل الحمض النووي الريبي الفيروسي ركيزة للـ MARylation، حيث تم التعرف على الحمض النووي الريبي (RNA) في المختبر وفي الخلايا [83،84].

4.3. تنظيم المجال لـ PARPs الخاضعة للتنظيم IFN

تجدر الإشارة إلى أن PARPs المستجيبة لـ IFN تعرض جميع مجالات العرض والزخارف التي يحتمل أن تكون متورطة في ربط الحمض النووي (الشكل 1).

الشكل 1. بنية المجال لـ PARPs المستجيبة لـ IFN. يحتوي جميع أفراد عائلة PARP المستجيبين لـ IFN على مجال ADP-ribosyltransferase (ART) المحفوظ في الطرف C الخاص بهم. باستثناء PARP13، يمتلك مجال ART الخاص بـ PARPs الأخرى نشاط MARylation [72،73]. تحتوي PARP9 وPARP14 وPARP15 على تكرارات المجال الكلي (MD)، إما 2 كما في حالة PARP9 وPARP15. الشكل 1. بنية المجال لـ PARPs المستجيبة لـ IFN. يحتوي جميع أفراد عائلة PARP المستجيبين لـ IFN على مجال ADP-ribosyltransferase (ART) المحفوظ في الطرف C الخاص بهم. باستثناء PARP13، يمتلك مجال ART الخاص بـ PARPs الأخرى نشاط MARylation [72،73]. تحتوي PARP9 وPARP14 وPARP15 على تكرارات المجال الكلي (MD)، إما 2 كما في حالة PARP9 وPARP15، أو ثلاثة كما هو موضح في PARP14. بالإضافة إلى المجالات الكبيرة الثلاثة، تم تجهيز PARP14 أيضًا بنموذجين للتعرف على الحمض النووي الريبي (RRM) عند طرفه N، المعروفين بالتوسط في ربط الحمض النووي الريبي (RNA). وبالمثل، يحمل PARP10 اثنتين من RRMs في نهايته N. PARP11-يحتوي PARP14 على وحدة واحدة (PARP11، PARP14) أو وحدتين من وحدات WWE (PARP12، PARP13)، المعروفة بتسهيل ربط poly-ADP-ribose. يحتوي كل من N-terminal PARP12 وPARP13 على مجالات ربط الحمض النووي المجنحة الشبيهة بالحلزون (WH-l) متبوعة بخمسة أشكال لأصابع الزنك (ZF)، المعروفة بالتوسط في الارتباط بالأحماض النووية. يعد PARP10 فريدًا من نوعه، لأنه العضو الوحيد في العائلة المجهز بزخارف تفاعل اليوبيكويتين (UIMs)، والتي يحمل ثلاثة منها في نصفه الطرفي C (تم الإنشاء باستخدام BioRender.com).

يشبه PARP12 بنية المجال العام لـ PARP13 وهو مزود أيضًا بالعديد من ZnFs. يتم وصف هذه المجالات بشكل جيد على أنها وحدات ربط الحمض النووي، من بين وظائف أخرى، وعلى هذا النحو تشارك على نطاق واسع في التفاعلات بين المضيف ومسببات الأمراض [85]. يثير هذا تساؤلات حول الوظيفة (الوظائف) التي يمكن تخصيصها لـ ZnFs في PARP12 وما إذا كانت متورطة في استشعار الحمض النووي الريبي (RNA). هناك أدلة متراكمة على أن المجالات الكبيرة تمثل وحدة ربط إضافية للحمض النووي. في الآونة الأخيرة، ثبت أن PARP9 يرتبط بالحمض النووي الريبي الفيروسي (RNA) الفيروسي بوساطة مجاله الكبير الأول [15]. لقد تم توضيح إمكانية الارتباط بـ RNA لـ TARG1 أيضًا [86]. تم أيضًا إنشاء المجال الكبير كوحدة ربط للأحماض النووية من خلال النتائج التي تم التوصل إليها مع بعض المجالات الكبيرة الفيروسية (MDs). ثبت أن vMD لفيروس Chikungunya (CHIKV) أو فيروس التهاب الدماغ الفنزويلي (VEEV) يرتبط بـ ssRNA [87]، في حين أن vMD الثاني والثالث (نطاقات السارس الفريدة، SUD) لفيروس السارس-كورونا قد ثبت أنه يرتبط بـ G-quadruplexes [88،89]. إلى جانب PARP9، ينتمي PARP14 وPARP15 إلى PARPs المحفزة بواسطة IFN والتي تحتوي على المجال الكلي. في حين تم تحديد PARP14 macro2 وmacro3 وكذلك PARP15 macro2 لربطهما بـ MAR [75،90]، فإن وظيفة المجال الكبير الأول داخل كلا البروتينين تظل بعيدة المنال. ومع ذلك، استنادًا إلى مقارنات التسلسل، فهي أقرب من الناحية التطورية إلى المجالات الكبيرة المحللة التي تم تشفيرها بواسطة فيروسات ssRNA، مما قد يسمح لها بافتراض القدرة على ربط الحمض النووي الريبي (RNA) أيضًا (الشكل 2). بالإضافة إلى مجالاته الكبيرة، يعرض PARP14 نموذجين للتعرف على الحمض النووي الريبي (RRMs) بالقرب من نهايته N، والتي تفصلهما منطقة مضطربة جوهريًا (IDR، وفقًا لتحليل تسلسل الأحماض الأمينية باستخدام PONDR) عن مجالاتها الوظيفية الأخرى. وهذا هو الحال أيضًا بالنسبة لـ PARP10 (التحليل بواسطة PONDR) (الشكل 1). يمكن لـ RRMs ولكن أيضًا IDRs بشكل فردي أو تعاوني التوسط في ربط الحمض النووي الريبي (RNA) [91-93]. بشكل عام، تعمل RRMs المتعددة جنبًا إلى جنب مما يسهل ربط الحمض النووي الريبي (RNA) المناسب ويمنح خصوصية الحمض النووي الريبي (RNA) [94]. سيكون من المثير للاهتمام تقييم أوضاع ربط الحمض النووي لهذه المجموعة الفرعية من PARPs. هل تستشعر هذه المجالات بالفعل أن الأحماض النووية الأجنبية تساهم في استجابة قوية مضادة للفيروسات؟

Figure 2. Phylogenetic tree of humans and some selected viral macrodomains. Amino acid sequences (>sp|O75367|184-370_MacroH2A1.1; >sp|Q9P0M6|184-370_MacroH2A1.2; >sp|Q9P0M6|184 -370_MacroH2A2; >sp|Q86WJ1|704-897_ALC1; >sp|Q9Y530|2-152_TARG; >sp|Q8IXQ6|107- 296_PARP9-macro1; >sp|Q8IXQ6|306-487_PARP9-macro2; >sp|Q460N5|791-978_PARP14- macro1; >sp|Q460N5|1003-1190_PARP14-macro2; >sp|Q460N5|1216-1387_PARP14-macro3; >sp|Q460N3|78-267_PARP15-macro1; >sp|Q460N3|293-464_PARP15-macro2; >sp|Q9BQ69|141- 322_MacroD1; >sp|A1Z1Q3|59-240_MacroD2; >sp|Q9NXN4|43-223_GDAP2; >sp|P36328|1330- 1489_VEEV-macro; >sp|Q8JUX6|1334-1493_CHIKV-macro; >sp|Q8QZ73|1335-1493_MAYVmacro; >sp|P0DTD1|1025-1194_SARSCoV2-macro1; >sp|P0DTD1|1231-1359_SARSCoV2- macro2; >sp|P0DTD1|1367-1494_SARSCoV-macro3; >sp|Q9WC28|775-921_HEV-macro; >sp|K9N7C7|1110-1276_MERS-macro1; >تم تحليل sp|K9N7C7|1278-1404_ MERS-macro2) بواسطة CLUSTAL 2.1 وتم تحميل ملف شجرة النشوء والتطور إلى iTOL 6.6 لإنشاء شجرة النشوء والتطور هذه [95].

4.4. PARPs الخاضعة للتنظيم IFN كعوامل تقييد المضيف

كما ذكرنا سابقًا، يمتلك PARP12 تنظيم مجال مشابه لـ PARP13 لكن مجال ART الخاص به يعرض النشاط الأنزيمي [16] (الشكل 1). في حين أن PARP13 معروف بالفعل بدوره باعتباره PRR في الاستجابة المناعية الفطرية، فقد يتم افتراض وظيفة مماثلة لـ PARP12 [11،96]. ومع ذلك، لم يتم تأكيد ربط PARP12 RNA تجريبيًا حتى الآن، ولكن هناك أدلة قادمة من تجنيد PARP12 في SGs [67،97،98]. SGs عبارة عن مكثفات غنية بالـ mRNA بسبب مجمعات الترجمة المتوقفة المعتمدة على الإجهاد وPAR [67،99]. يعتمد توطين PARP12 على هذه المكثفات على نطاقات ZnFs وWWE، مما يشير إلى أن القدرة على ربط كل من RNA وPAR تستفز PARP12 للترجمة إلى SGs [97،98]. تجدر الإشارة إلى أنه مثل ربط RNA، لم يتم التحقق من صحة ربط PAR بواسطة مجال WWE الخاص بـ PARP12 تجريبيًا. لم يتم بعد العثور على دور وظيفي لـ PARP12 في حبيبات بيولوجيا SG، ولكن بما أن SGs تمت مناقشتها كاستجابة الخط الأول للعدوى الفيروسية، فإن تنظيم و/أو تعديل هذه المكثفات قد يكون أحد طرق العمل المضاد للفيروسات لـ PARP12 [100 ]. تجدر الإشارة إلى أنه بالإضافة إلى PARP13 وPARP12، تم تحديد PARP14 وPARP15 كبروتينات SG أيضًا، على الأقل عند التعبير عنها بشكل مفرط [67]. سيكون من المثير للاهتمام تحليل ما إذا كان PARP12، المشابه لـ PARP13، ينظم دوران الحمض النووي الريبي (RNA) و/أو ترجمته وما إذا كان هذا يقتصر على الرناوات الفيروسية أو قد يكون أيضًا ذا صلة بالرنا المرسال المضيف في الخلايا المصابة وبالتالي المجهدة. تم استنتاج خط إضافي من الأدلة على PARP12 باعتباره بروتينًا مرتبطًا بالحمض النووي الريبوزي (RNA) من الأبحاث الحديثة لـ SARS-CoV-2. كشف تحديد العوامل المضيفة التي تتفاعل مع جينوم SARS-CoV-2 RNA عن PARP12 وPARP13 كبروتينات متفاعلة [58,101].

في الواقع، تم تحديد PARP12 كعامل تقييد لبعض الفيروسات [81،102،103]. إحدى الآليات المحتملة التي تتم مناقشتها هي الحد من تكرار فيروس ألفا عن طريق تعديل الترجمة الخلوية [102]. عند الإصابة بـ VEEV، يبدو أن PARP12 معقد مع الريبوسومات والعديد من البروتينات المعروفة بأنها تلعب دورًا في الترجمة [102]. قد يوفر هذا أيضًا رابطًا لبيولوجيا SG و/أو تعديل هذه المكثفات حيث يتم إثرائها في مجمعات الترجمة المتوقفة [100]. بالإضافة إلى ذلك، يحد PARP12 من تكاثر فيروس زيكا (ZIKV) في الواقع عند التفاعل مع PARP11 عبر نطاقات WWE الخاصة بهم [104,105]. هنا، يتم التوسط في التأثير المقيد من خلال تعزيز PARylation للبروتينات الفيروسية غير البنيوية NS1 وNS3 التي تستهدفها للتحلل البروتيزومي [104،105]. يشبه هذا طريقة العمل الموضحة في PARP13.1 فيما يتعلق ببروتينات IAV التي يتم تحضيرها بواسطة PAR للتحلل البروتيني [62]. مرة أخرى، من المفترض أن تشارك إنزيمات PARP أخرى أيضًا في هذه العملية، حيث لا يتم تحفيز PARylation بواسطة PARP12 أو PARP11 [72]. تم تحديد PARP11 كمنظم لإشارات IFN. لقد ثبت أنه يحفز MARylation لـ -TrcP، وهو إنزيم يوبيكويتين E3. وينتج عن هذا الانتشار اللاحق ودوران IFN / المستقبل 1 (IFNAR1) مما يشير إلى التحكم في ردود الفعل لإشارات IFN بواسطة PARP11 [106]. يعد PARP9، إلى جانب PARP14 وPARP15، أحد PARPs التي تحتوي على المجال الكلي [16] (الشكل 1). ومع ذلك، حتى الآن، لم يتم توضيح PARP9 بشكل كامل، سواء كان لديه نشاط ريبوسيليت ADP أم لا [16]. تم تحديد المجالات الكبيرة لـ PARP9 لربط PAR مما يتيح تنسيق PARP9 مع إنزيم PARylating PARP1 عند تلف الحمض النووي [107،108]. علاوة على ذلك، تمت مناقشة الدور المضاد للفيروسات لـ PARP9. في الخلايا الجذعية، يحفز فيروس الأنفلونزا A، وهو فيروس RNA سالب الجديلة، التعبير عن PARP9 [15]. علاوة على ذلك، أبلغ شينغ وزملاؤه عن وجود تأثير وقائي لـ PARP9 ضد فيروس التهاب الفم الحويصلي لفيروس الحمض النووي الريبوزي ناقص المعنى وعدوى فيروس الرنا المزدوج الجديلة في الفئران، في حين أن هذا التأثير لا يحدث مع فيروس الحمض النووي الهربس البسيط من النوع 1 (HSV-1) ) [15]. لقد وجدوا أن المجال الكبير الأول لـ PARP9 ضروري لربط الرنا المزدوج الجديلة الفيروسي الذي يتراوح من 1100 زوج أساسي (bp) إلى 1400 زوج أساس (الجدول 1). علاوة على ذلك، يساهم PARP9 بشكل كبير في إنتاج النوع الأول من الإنترفيرون عن طريق تنشيط مسار إشارات الفوسفونوسيتيد -3- كيناز/بروتين كيناز B (PI3K/AKT) [15]. ومع ذلك، بالنسبة للعديد من العمليات، يشكل PARP9 ثنائيًا متغايرًا مع E3 ubiquitin ligase الذي يحذف E3 ubiquitin ligase L (DTX3L). يلعبون معًا دورًا في إصلاح تلف الحمض النووي والدفاع المضاد للفيروسات [15,108]. إن heterodimer DTX3L / PARP9 قادر على MARylating ubiquitin بشكل انتقائي [108]. يقترح المؤلفون أن هذا التعديل يعتمد على النشاط التحفيزي لـ PARP9 [108]. وجد روسو وزملاؤه أن الثنائي المغاير DTX3L/PARP9 يلعب دورًا مركزيًا في الريبوسيلات ADP المستحثة عند تحريض ISGs. يبدو أن هذا مستقل عن نشاط PARP9 نفسه، مما يشير إلى وجود تداخل محتمل مع MARylating PARPs الأخرى أو عمل منسق لهذه البروتينات. يتم عكس الزيادة في MARylation الإجمالي من خلال نشاط هيدرولاز لـ SARS-CoV -2 nsP3 Macrodomain1 [109,110]. في عام 2016، اكتشف إيواتا وزملاؤه أن محول الإشارة ومنشط النسخ 1 (STAT1) وSTAT6 يتم ريبوسيلات ADP في المختبر بواسطة PARP14، وهي عملية تم قمعها بواسطة PARP9. وزعموا أيضًا أن فسفرة STAT1 تم تثبيتها بواسطة PARP14 بوساطة STAT1 ADP-ribosylation [111]. بالإضافة إلى ذلك، لوحظ دور PARP14 المضاد للالتهابات في البلاعم، مما يعزز استجابة الإنترلوكين (IL) -4 وقمع الاستجابات التي يسببها IFN، [111]. على الرغم من أن هذا العمل قد تلقى انتقادات قوية [112]، إلا أنه على الأقل تم تأكيد تفاعل PARP9-PARP14 في تجارب الهطول المناعي المشترك التي أجرتها مجموعات أخرى [113]. يقترح جرونوالد وزملاؤه أن PARP14 يمكنه تنظيم استجابة الإنترفيرون، اعتمادًا على الـ ADP-ribosylation، ولكن أيضًا بشكل مستقل عن نشاطه التحفيزي [114]. علاوة على ذلك، لاحظوا زيادة التكاثر الفيروسي لفيروس التهاب الكبد الفأري (MHV) في تجارب تثبيط Parp14 والقضاء عليه، مما يشير إلى القدرات المضادة للفيروسات لـ PARP14 [114]. في تجارب التشابك الفيروسي وتنقية الطور الصلب (VIR-CLASP) لفيروس شيكونغونيا (CHIKV)، تم تحديد PARP14 وPARP9 كمتفاعلات CHIKV-RNA [115]. في المقابل، لم تكشف شاشة تفاعلات جينوم IAV عن تفاعل أي من ARTDs الأحادية [115]. يحتوي PARP14 على ثلاثة نطاقات كبيرة، وقد تم الإبلاغ عن ارتباط ماكرو2 وماكرو3 بـ MARylated PARP10 ولكن يبدو أنه يفتقر إلى نشاط هيدرولاز وبالتالي يعتبر بمثابة قراء MARylation [75]. ومن المثير للاهتمام، أن المجال الكلي PARP14 تم وصفه ليشبه، على الأقل على مستوى التسلسل، المجال الكلي لـ SARS-CoV-2 (الشكل 2) [116,117]. يعد PARP14 أكبر إنزيمات PARP وله نموذج التعرف على الحمض النووي الريبي (RRM) في نهايته N متبوعًا بمنطقة طويلة مضطربة جوهريًا، ووظيفتها غير معروفة حتى الآن [118]. يرتبط PARP14 بـ 3'UTR لعامل الأنسجة mRNA بالتآزر مع تريستيترابرولين (TTP) عند تحفيز عديد السكاريد الدهني (LPS) (الجدول 1) [119]. ومع ذلك، ما هي مجالات PARP14 المتضمنة في هذا التفاعل أو ما إذا كان PARP14-يساهم-ريبوسيل ADP في هذا التفاعل لا يزال يتعين تحديده [119]. تم أيضًا الإبلاغ عن ارتباط الحمض النووي لـ PARP14 بواسطة رايلي وزملائه، الذين وجدوا نموذجين مفترضين للحمض النووي تم التعرف عليهما بواسطة PARP14 (الجدول 1). توجد هذه العناصر في المنطقة المحفزة للإنترلوكين-4 (Il-4) وIl-5 ويبدو أن PARP14 له دور في التعبير عن السيتوكينات من النوع T المساعد 2 (Th2) [ 120]. ويدعم هذا أيضًا النتائج المتعلقة بدور PARP14 في تفاعلات الحساسية لدى الفئران [121]. تم العثور على PARP14 ليكون موضعيًا بشكل رئيسي في العصارة الخلوية وينتقل إلى النواة عند علاج LPS [113]. ويبدو أيضًا أنه يشارك في نقل البروتينات الأخرى إلى النواة، خاصة تلك التي تحفز الإنترفيرون [113]. يتم التعبير عن PARP10 بشكل كبير في الخلايا المكونة للدم، مما يدعم دورًا وظيفيًا في المناعة الفطرية [122]. مثل PARP12، ثبت أن PARP10 مقيد لتكاثر الفيروس [81,102,103]. أظهر أتاشيفا وزملاؤه أن التعبير عن PARP10 من مروج الجينوم الثاني داخل جينوم VEEV يؤدي إلى تثبيط الترجمة [102]. ومع ذلك، تظل كيفية تداخل PARP10 مع الترجمة مفتوحة. وبالمثل، من غير الواضح ما إذا كان هذا التعديل المحتمل للترجمة يمنح نشاطه المضاد للفيروسات.

الجدول 1. نظرة عامة على طرائق ربط الحمض النووي الريبي (RNA) لـ PRRs الكلاسيكية وPARPs التي ينظمها IFN.

في الآونة الأخيرة، تم تحديد البروتين غير الهيكلي (nsP) 2 من CHIKV باعتباره ركيزة PARP10. يضعف MARylation نشاط التحلل البروتيني لـ nsP2، وهو أمر ضروري للنسخ المتماثل [81]. تتم ترجمة CHIKV nsPs على أنها بروتينات متعددة تحتاج إلى معالجتها في nsPs الفردية، والتي تشكل لاحقًا مجمع النسخ المتماثل الوظيفي [123]. وبالتالي، يمكن التوسط في النشاط المضاد للفيروسات لـ PARP10، جزئيًا على الأقل، عن طريق تعديل وتنظيم البروتينات الفيروسية. ومن المثير للاهتمام، أن MARylation لـ CHIKV-nsP2 لم تتم ملاحظته إلا عند محاكاة عدوى فيروسية عن طريق ترنسفكأيشن لنسخة RNA المنسوخة في المختبر. لم يكن التعايش القائم على البلازميد لـ GFP-nsP2 وPARP10 كافيًا للحث على MARylation [81]. وقد لوحظت نتائج مماثلة في دراسة الـ ADP-ribosylation في سياق الإصابة بفيروس التهاب الكبد الفأري (MHV)، وهو فيروس تاجي. تم العثور على بروتين القفيصة النووية (N) الخاص بـ MHV على أنه مركب ADP-ribosylated عند الإصابة بـ MHV وفشل في التعديل عند التعبير عنه خارجيًا في الخلايا [80]. هذه النتائج تعزز التكهنات. هل وجود الحمض النووي الريبي الفيروسي ضروري للتنشيط الكامل لـ PARP10 بالإضافة إلى PARPs الأخرى؟ يمتلك PARP10 من N-terminal اثنين من RRMs بالقرب من الطرف N. ويتبع ذلك مجال مضطرب جوهريًا وغني بالجليسين (الشكل 1). ما إذا كانت هذه العناصر تمكن ربط الحمض النووي، فيجب التحقيق فيها لمعالجة مسألة ما إذا كان PARP10 قد يعمل كـ PRR. كما أشير أعلاه، تم تحديد الحمض النووي الريبي (RNA) كركيزة لـ MARylation [83،84،124،125]. المجالات الحفزية المعزولة لـ PARP10 وكذلك PARP15 قادرة على MARylating الفوسفات الطرفي 50 من ssRNA في المختبر. ومع ذلك، فشلت المتغيرات الكاملة لهذه البروتينات في القيام بذلك في المختبر [83،84]. إن إنزيم ADP-ribosyltransferase المحدد لـ MARylate RNA كبروتين كامل الطول في المختبر وفي الخلايا، هو TRPT-1. لقد ثبت أن MARylation لـ 50 - P-RNA يمنع الترجمة [84].

4.5. منظور على PARPs الخاضعة للتنظيم IFN كأجهزة استشعار للحمض النووي الريبي الفيروسي

cistanche tubulosa-تحسين الجهاز المناعي

ما الذي يمكن استخلاصه من هذه النتائج؟ من الواضح تمامًا أن PARPs تشارك في الدفاع المضاد للفيروسات. هناك أدلة متزايدة تربط هذه المجموعة الفرعية من إنزيمات PARP المستجيبة للإنترفيرون بالمناعة الفطرية، كما تم تلخيصها في المراجعات الأخيرة [16,109,118]. ومع ذلك، نظرًا لأن هذا مجال بحثي ناشئ وسريع التطور، فهناك الكثير من الأسئلة المفتوحة التي يجب معالجتها والإجابة عليها. وإلى جانب التحريض بواسطة الإنترفيرون، فإننا بالكاد نفهم كيفية تنظيم التعبير عن جينات PARP ووظيفة البروتينات المشفرة. كيف يتم تنظيم نشاطهم التحفيزي؟ هل هناك حاجة إلى تنظيم دقيق لنشاط MAR؟ كيف يتم تحقيق دوران هذه البروتينات؟ ما هي وظائف مجالات البروتين المتنوعة التي تم تجهيز بروتينات PARP بها؟ هل هناك تداخل بين هذه المجالات المختلفة، وهل توفر وظائف منفصلة عن نشاط MAR؟ علاوة على ذلك، كيف تتآزر الإنزيمات الفردية للمساهمة في إنشاء استجابة قوية مضادة للفيروسات؟ ما هي جزيئات الركيزة (البروتين أو الأحماض النووية) التي تعمل على ضبط الاستجابة المناعية لواحد أو آخر من مسببات الأمراض؟ كيف يتم تحقيق الخصوصية؟ في هذا القسم الأخير، نود أن نتكهن بالإجابات المحتملة لهذه الأسئلة. استنادًا إلى تنظيم المجال الخاص بهم (الشكل 1)، نتوقع أن هذه المجموعة الفرعية من PARPs تتفاعل مع الأحماض النووية الأجنبية ولكن ربما أيضًا مع الأحماض النووية الخلوية. يُظهر RNA الفيروسي الكثير من الهياكل الثانوية، والتي قد تسمح، إلى جانب تسلسل و/أو تعديل RNA، بالتعرف والربط [126,127]. هذه الهياكل الثانوية المعقدة، التي يقع معظمها في 5'UTR و3'UTR من الرناوات الفيروسية، تحميها من التعرف عليها من قبل العديد من أجهزة استشعار ssRNA [128]. بالإضافة إلى ذلك، طورت الفيروسات استراتيجيات مختلفة، مثل انتزاع الغطاء (سرقة الغطاء من mRNA المضيف) أو تقليد الغطاء لتجنب التعرف عليه من خلال تقارير PRR الكلاسيكية [129]. وبالتالي، فمن المتصور أن PARPs، مثل PARP9، تدخل حيز التنفيذ (الشكل 3). من خلال ربط الحمض النووي الريبي (RNA)، قد يساعدون في تنشيط PRRs الكلاسيكية، كما هو موضح في PARP13 بالتنسيق مع RIG-I [11].

الشكل 3. PARPs التي ينظمها IFN وأجهزة استشعار للحمض النووي الريبي الأجنبي والعواقب المحتملة لهذا التفاعل.

لم يتم توضيح الرابط المباشر لتنشيط الجسيم الالتهابي بعد، لكن NLRP3، الذي يتم تنشيطه على نطاق واسع من RNAs يعتمد بشكل كامل على البروتينات الملحقة، لأنه ليس لديه قدرة جوهرية على ربط RNA [49]. في مثل هذه السيناريوهات، يمكن لـ PARPs أن تلعب دورًا لاستشعار الأحماض النووية ونتيجة لذلك ترتبط بتنشيط PRR وتتوسطه. قد يتم التحكم في هذا عن طريق MARylation. في الواقع، لقد تم بالفعل عرض ADP-ribosylation لـ NLRP3. يساهم PARylation بواسطة PARP1 في تنشيطه وتجميعه لاحقًا [130]. لقد ثبت أن المزيد من MARylation لـ NLRP3 بواسطة السموم البكتيرية يساهم في تنشيط الالتهاب [131]. سيكون من المثير للاهتمام اختبار ما إذا كانت PARPs الخاضعة للتنظيم IFN قد تربط بين استشعار الحمض النووي الريبي (RNA) وتنشيط الالتهاب وما إذا كان هذا مستقلاً عن MARylation. قد يؤدي ربط الحمض النووي الريبي (RNA) إلى تنشيط إنزيمات PARP ويساهم في الخصوصية، كما هو مقترح من خلال النتائج مع CHIKV-nsP2 أو البروتين N لـ MHV (الشكل 3) [80،81]. في هذه الدراسات، لا يمكن ملاحظة تعديل البروتينات الفيروسية إلا بعد الإصابة وبالتالي وجود الحمض النووي الريبي الفيروسي. إن مفهوم تنشيط الإنزيم المعتمد على الحمض النووي معروف منذ فترة طويلة بـ PARP1، والذي يتم تنشيطه بالكامل فقط عند وجود الحمض النووي المشقق بسبب الحديث المتبادل بين ZnF III ومجال ART [132]. يمكن تصور هذا الحديث المتبادل في المجال بشكل جيد بالنسبة لـ PARPs الخاضعة للتنظيم IFN أيضًا. هناك وضع آخر للتنشيط، على الرغم من كونه تخمينيًا للغاية في الوقت الحالي، قد يكون مشابهًا لكيفية تنشيط RIG-I [25]. قد تساهم RRMs والمنطقة الغنية بالجليسين المضطربة بشكل جوهري والموجودة في PARP10 وPARP14 في تكوين غير نشط، والذي يفتح عندما تتفاعل البروتينات مع RNA (الشكل 3). قد يسمح مثل هذا التشكل الأكثر انفتاحًا بالنشاط التحفيزي و/أو التعرف على الركائز. وبالتالي، سيكون من المثير للاهتمام توضيح ما إذا كانت مثل هذه التفاعلات داخل الجزيئات تحدث وكيف يتم تنظيمها. علاوة على ذلك، تمت مناقشة اختلاط إنزيمات PARP مؤخرًا [133]. قد يتم التغلب على الاختلاط من خلال العوامل المشتركة. على سبيل المثال، يوجه HPF-1 نشاط PARP1 نحو تعديل السيرين وقد تمت مناقشة DTX3L لمنح النشاط التحفيزي PARP9 [108,134]. هناك فكرة مثيرة للاهتمام وهي أنه بالإضافة إلى البروتينات التي تعمل كعوامل مساعدة، قد ينقل الحمض النووي الريبي (RNA) أيضًا الخصوصية وبالتالي تحويل ذخيرة محتملة من الركائز (الشكل 3). بالتفكير في هذا الأمر بشكل أكبر، قد يؤدي ربط الحمض النووي الريبي (RNA) أيضًا إلى تعديل ركيزة معينة بدلاً من التعديل التلقائي. علاوة على ذلك، فقد تبين أن تثبيط النشاط التحفيزي لبعض الـ PARPs يزيد من ثباتها، مما يشير إلى أن التعديل التلقائي يثير التدهور البروتيني [82]. وبالتالي، فإن ربط RNA لـ PARPs هذه قد يقلل من التعديل التلقائي بسبب التغيرات في خصوصية الركيزة، وبالتالي تعزيز استقرار PARPs المستجيبة لـ IFN. قد تكون هذه الزيادة في البروتين مهمة لتعزيز القدرة الخلوية على التعرف على الأحماض النووية المسببة للأمراض. علاوة على ذلك، بمجرد حل إجهاد العدوى وإزالة الحمض النووي الريبي (RNA) الغريب من الخلايا، فإن PARPs ستعود مرة أخرى إلى التعديل التلقائي، مما يعزز تدهورها. وبالتالي، فإن مثل هذا السيناريو من شأنه أن يعزز في البداية ثم يشارك لاحقًا في إيقاف الاستجابة المناعية الفطرية في الوقت المناسب، وبالتالي منع التأثيرات السامة بسبب حقيقة تجاوز المناعة. قد تتداخل قدرات ربط الحمض النووي الريبي (RNA) لإنزيمات PPARP مع الترجمة الفيروسية. تحتوي فيروسات ألفا، على سبيل المثال، على محتوى عالي من CpG وبالتالي يتم التعرف عليها واستهدافها بواسطة PARP13 [129]. وقد تبين أن PARP13 بدوره يتفاعل مع عامل بدء ترجمة حقيقيات النواة 4G (eIF-4G) وeIF-4A [129]. قد تتداخل PARPs المرتبطة بالمجال الكبير مع ترجمة SARS-CoV-2 RNA. يتحول فيروس SARS-CoV-2 nsP3 إلى حويصلات ذات غشاء مزدوج مشتقة من ER [60]. تبين أن SUD لـ nsP3، الذي يتكون من نطاقين فيروسيين كبيرين ومجال يسبق 2 الشبيه باليوبيكويتين (Ubl2) والبروتياز الشبيه بالبابين 2 (PL2pro) (DPUP)، يتفاعل مع الريبوسومات والبروتين المتفاعل مع البروتين متعدد الأدينيلات 1 ( PAIP1) [128]. ويعتقد أن هذا التفاعل حاسم للترجمة الفيروسية. علاوة على ذلك، من المعروف أن المجالات الكبيرة في SUD قادرة على ربط G-quadruplexes، وفي حالة الماكرو3، ربما poly-A [128]. إن ربط الحمض النووي الريبي الفيروسي (RNA) الفيروسي بالمجالات الكبيرة nsP3 SUD يمكن أن يحميهم أيضًا من التعرف على المجالات الكبيرة البشرية. ومع ذلك، لا يزال هذا الافتراض غامضًا إلى حد ما، حيث لم يظهر بعد أن الحمض النووي الريبي الفيروسي يرتبط بـ CoV-2 SUD MDs، ولا أن MDs البشرية ستكون قادرة على التفاعل مع الحمض النووي الريبي الفيروسي هنا. وبدلاً من ذلك، قد ترتبط المجالات الفيروسية الكبيرة بجزيئات mRNA المضيفة وبالتالي تعيق ترجمتها مع nsP1 [128]. ومع ذلك، في كلتا الحالتين، من المثير للاهتمام أيضًا ملاحظة قرب الطرف N الفيروسي الماكرو 1 المجاور لـ SUD. يحتوي Macro1 على نشاط هيدرولاز، مما يشير إلى أن PARPs أو ADP-ribosylation متورطون في تخفيف الفيروسات عن طريق التدخل في ترجمتها [135]. يمكن أن يكون الحمض النووي الريبي الفيروسي نفسه ركيزة (الشكل 3). فشلت الدراسات المختبرية في إظهار MARylation بواسطة PARP10 كامل الطول أو PARP15 [84]. ومع ذلك، نظرًا للطبيعة الاصطناعية لامتداد 5'-P-RNA المستخدم في هذه التجارب المختبرية، لا يمكن استبعاد تعديل الحمض النووي الريبي (RNA) بواسطة إنزيمات PARP. مرة أخرى، قد تكون العناصر الهيكلية و/أو التسلسلية للحمض النووي الريبي (RNA) مهمة للربط ولتغيير نشاط و/أو خصوصية MARylation، وهي جوانب سيتم توضيحها من خلال الأبحاث المستقبلية. يمكن أيضًا أن يتم التفاعل والتعاون بين PARPs بواسطة RNA. يبدو أن العديد من هذه الـ PARPs، على الأقل عندما يتم التعبير عنها بشكل مفرط، تشكل مكثفات في الخلايا [136]. يلعب الحمض النووي الريبي (RNA) دورًا مهمًا كسقالة في العديد من المكثفات. قد يسمح MARylation بالإضافة إلى الحمض النووي الريبي (RNA) بتجنيد PARPs في مثل هذه المكثفات. استنادًا إلى الدراسات التي أجريت على TARG1، يبدو أن ربط RNA وربط APD-ribose ليسا حصريين، مما يشير إلى أن المجالات الكبيرة قد تكون قادرة على التعرف على إشارات MAR وكذلك RNA في نفس الوقت [86]. بعد هذه الفكرة التأملية إلى حد ما عن PARPs كأجهزة استشعار للحمض النووي الريبي (RNA) الأجنبي والنتيجة المحتملة لتفاعل RRNA هذا، لا يزال هناك سؤال واحد واضح يجب الإجابة عليه. هل تحتاج PARPs الخاضعة للتنظيم IFN إلى تنظيم صارم؟ بما أنها متورطة في المناعة الفطرية، فهل يؤدي إلغاء القيود التنظيمية أو تنشيط الطفرات إلى ربط PARPs باضطرابات المناعة الذاتية؟ تجدر الإشارة أيضًا إلى أن إنزيمات PARP قد تكون بمثابة سيف ذو حدين، فهي لا تلعب دورًا مضادًا للفيروسات فحسب، بل يتم استغلالها أيضًا من قبل بعض الفيروسات. قد يكون أحد هذه المرشحات هو PARP11، كموازنة لإشارة IFN [106].

cistanche tubulosa-تحسين الجهاز المناعي

5. الاستنتاجات

لقد خلقت السنوات الأخيرة عدة خطوط من الأدلة تشير إلى أن مجموعة فرعية من MARylating ARTDs تلعب دورًا في المناعة الفطرية. مع كون البروتينات ومؤخرًا أيضًا الحمض النووي الريبي (RNA) ركائز لآليات MARylation المحتملة وكيفية منحها استجابة قوية مضادة للفيروسات، تتم مناقشة وتقييمها. بالإضافة إلى مجال العلاج المضاد للفيروسات القهقرية والتعديل عن طريق النشاط التحفيزي، فإن الأدوار المحتملة لمختلف المجالات الأخرى، والتي تم تجهيز PARPs الخاضعة للتنظيم IFN، أصبحت موضع التركيز لمساهماتها المحتملة في الأنشطة المضادة للفيروسات. ومن المؤكد أننا بعيدون كل البعد عن فهم التفاصيل الضرورية لوظائف بروتينات PARP هذه لرسم صورة شاملة لمشاركتها في المناعة الفطرية. ومع ذلك، في هذه المراجعة، نقدم إمكانيات لكيفية مساهمة المجالات الإضافية إلى جانب مجال ART في الإشارات المناعية الفطرية. إن الحصول على فهم أكثر اكتمالًا لوظائفها والتفاعل مع العوامل الفيروسية والمضيفة، سواء البروتين أو الحمض النووي الريبي (RNA)، سيحدد بالتأكيد نقاط انطلاق جديدة للتدخل الدوائي.

مراجع

1. كارتي، م.؛ جاي، سي؛ باوي، AG الكشف عن الالتهابات الفيروسية عن طريق المناعة الفطرية. الكيمياء الحيوية. فارماكول. 2021، 183، 114316. [CrossRef] [PubMed]

2. تشاو، كيه تي؛ غيل، م، الابن؛ Loo وYM RIG-I وأجهزة استشعار RNA الأخرى في المناعة المضادة للفيروسات. آنو. القس إيمونول. 2018، 36، 667-694. [CrossRef] [مجلات]

3. سعيد، عصام. تريمبلاي، ن.؛ البلوشي، MS؛ الجابري، أأ؛ لامار، د. الفيروسات التي تراها خلايانا: دور أجهزة استشعار الحمض النووي الريبي الفيروسي. جي إمونول. الدقة. 2018، 2018، 9480497. [CrossRef] [PubMed]

4. فيتزجيرالد، كا؛ كاجان، جي سي تول مثل المستقبلات والتحكم في المناعة. خلية 2020، 180، 1044-1066. [المرجع المتقاطع]

5. هوبفنر، KP. Hornung، V. الآليات الجزيئية والوظائف الخلوية لإشارات cGAS-STING. نات. القس مول. خلية بيول. 2020، 21، 501-521. [المرجع المتقاطع]

6. لوجرين، ج.؛ Martinon، F. The AIM2 inflammasome: مستشعر مسببات الأمراض والاضطرابات الخلوية. إيمونول. القس 2018، 281، 99-114. [المرجع المتقاطع]

7. ريهوينكل، ج.؛ مستقبلات Gack، MU RIG-I: تنظيمها وأدوارها في استشعار الحمض النووي الريبي (RNA). نات. القس إيمونول. 2020، 20، 537-551. [المرجع المتقاطع]

8. تشاو، سي؛ Zhao، W. NLRP3 Inflammasome-A لاعب رئيسي في الاستجابات المضادة للفيروسات. أمام. إيمونول. 2020، 11، 211. [المرجع المتقاطع]

9. شلي، م.؛ هارتمان، G. تمييز الذات عن غير الذات في استشعار الحمض النووي. نات. القس إيمونول. 2016، 16، 566-580. [المرجع المتقاطع]

10. شوارتز، إس إل؛ Conn، GL RNA تنظيم البروتين المضاد للفيروسات 20 -50 - سينثيتاس أوليجوادينيلات. وايلي Interdiscip. القس RNA 2019، 10، e1534. [المرجع المتقاطع]

11. فيكاريلي، م.؛ نيل، سجد. سوانسون، CM يستهدف تقييد التعبير الجيني الفيروسي وتكراره بواسطة نظام ZAP المضاد للفيروسات. آنو. القس فيرول. 2021، 8، 265-283. [المرجع المتقاطع]

12. أوشيومي، هـ؛ كواكي، T.؛ Seya، T. العوامل الإضافية لمستشعرات الحمض النووي الريبي الفيروسي السيتوبلازمي المطلوبة للاستجابة المناعية الفطرية المضادة للفيروسات. أمام. إيمونول. 2016، 7، 200. [المرجع المتقاطع]

13. سو، سي؛ تانغ، يد. Zheng، C. DExD / H-box طائرات الهليكوبتر: منظمات متعددة الوظائف في المناعة الفطرية المضادة للفيروسات. خلية. مول. علوم الحياة. 2021، 79، 2. [المرجع المتقاطع]

14. ويليامز، ف. هاوبريتش، ك.؛ بيريز-بوراجيرو، سي. Hennig، J. الأدوار الناشئة المرتبطة بـ RNA في عائلة TRIM من سلالات اليوبيكويتين. بيول. الكيمياء. 2019، 400، 1443-1464. [المرجع المتقاطع]

15. شينغ، J.؛ تشانغ، أ.؛ دو، Y.؛ فانغ، م. مينزي، LJ. ليو، YJ؛ لي، XC. Zhang، Z. تحديد بوليميريز بولي (ADP-ribose) 9 (PARP9) كمستشعر غير قانوني لفيروس الحمض النووي الريبي (RNA) في الخلايا الجذعية. نات. مشترك. 2021، 12، 2681. [المرجع المتقاطع]

16. لوشر، ب. فيرهيرسترايتن، م.؛ كريج، S.؛ Korn، P. داخل الخلايا أحادية ADP-ribosyltransferases في الطور البيني للفيروس المضيف. خلية. مول. علوم الحياة. 2022، 79، 288. [المرجع المتقاطع]

17. دوان، ت.؛ دو، Y.؛ شينغ، C.؛ وانغ، HY؛ وانغ، إشارات مستقبلات الترددات اللاسلكية ودورها في المناعة الخلوية. أمام. إيمونول. 2022، 13، 812774. [المرجع المتقاطع]

18. ليند، NA؛ رايل، VE. بيستال، ك؛ ليو، ب. بارتون، GM تنظيم المستقبلات الشبيهة بالحمض النووي. نات. القس إيمونول. 2022، 22، 224-235. [المرجع المتقاطع]

19. فيربوخن، ت.؛ شتاين، ك. Heine، H. RNA له تأثيره: تأثير المستقبلات الشبيهة بالـ RNA الخاصة على الصحة والمرض. الحساسية 2019، 74، 223-235. [المرجع المتقاطع]

20. كروسلي، النائب. سونغ، سي؛ بوكيك، إم جي؛ تشوي، JH. قصوروس، ج.؛ ساثيراشيندا، أ؛ لين، C.؛ بريكنر، جي آر؛ باي، ج.؛ لانس، ه.؛ وآخرون. تعمل هجينة RNA-DNA السيتوبلازمية المشتقة من حلقة R على تنشيط الاستجابة المناعية. طبيعة 2023، 613، 187-194. [المرجع المتقاطع]

21. وونجسوراوات، ت.؛ غوبتا، أ؛ جينجارونبون، ب. أوينز، S .؛ فورست، جي سي؛ Nookaew, I. تحليل تسلسلات تشكيل حلقة R في الآلاف من الجينومات الفيروسية يحدد عنصرًا مشتركًا جديدًا في فيروسات الهربس. الخيال العلمي. النائب 2020، 10، 6389. [CrossRef] [PubMed]

22. تانجي، هـ؛ أوهتو، يو. شيباتا، ت.؛ تاوكا، م.؛ ياماوتشي، Y.؛ إيزوبي، ت.؛ مياكي، ك.؛ Shimizu، T. مستقبل يشبه Toll-like 8 يستشعر منتجات تحلل الحمض النووي الريبي المفرد الذي تقطعت به السبل. نات. هيكل. مول. بيول. 2015، 22، 109-115. [CrossRef] [مجلات]

23. تشانغ، Z .؛ أوهتو، يو. شيباتا، ت.؛ كرايوخينا، إي؛ تاوكا، م.؛ ياماوتشي، Y.؛ تانجي، ه.؛ إيزوبي، ت.؛ أوشياما، S .؛ مياكي، ك.؛ وآخرون. يكشف التحليل الهيكلي أن مستقبل Toll-like 7 هو مستقبل مزدوج للجوانوسين والحمض النووي الريبي المفرد الذي تقطعت به السبل. الحصانة 2016، 45، 737-748. [CrossRef] [مجلات]

24. ثوريسن، د.؛ وانغ، دبليو؛ جالس، د.؛ قوه، ر. شو، L.؛ Pyle، AM الآلية الجزيئية لتنشيط RIG-I والإشارات. إيمونول. القس 2021، 304، 154-168. [CrossRef] [مجلات]

25. وانغ، دبليو. Pyle، AM يتبنى مستقبل RIG-I مطابقتين مختلفتين لتمييز المضيف عن روابط RNA الفيروسية. مول. خلية 2022، 82، 4131-4144.e6. [المرجع المتقاطع]

26. بيرك، آي سي؛ لي، Y.؛ Modis، Y. الأساس الهيكلي للتعرف المناعي الفطري على الحمض النووي الريبي الفيروسي. خلية. ميكروبيول. 2013، 15، 386-394. [المرجع المتقاطع]

27. برونز، صباحا. تآزر Horvath، CM LGP2 مع MDA5 في التعرف على الحمض النووي الريبي (RNA) بوساطة RLR والإشارات المضادة للفيروسات. السيتوكين 2015، 74، 198-206. [المرجع المتقاطع]

28. وو، ب. بيسلي، أ.؛ ريتشاردز، C .؛ ياو، ه.؛ تسنغ، X.؛ لين، C.؛ تشو، F.؛ والز، T.؛ Hur، S. الأساس الهيكلي للتعرف على الرنا المزدوج الجديلة، وتكوين الخيوط، وتنشيط الإشارة المضادة للفيروسات بواسطة MDA5. خلية 2013، 152، 276-289. [المرجع المتقاطع]

29. ساتوه، ت.؛ كاتو، ه.؛ كوماجاي، Y.؛ يونياما، م.؛ ساتو، س.؛ ماتسوشيتا، ك.؛ تسوجيمورا، T.؛ فوجيتا، T .؛ أكيرا، س.؛ Takeuchi, O. LGP2 هو منظم إيجابي للاستجابات المضادة للفيروسات بوساطة RIG-I وMDA5-. بروك. ناتل. أكاد. الخيال العلمي. الولايات المتحدة الأمريكية 2010، 107، 1512-1517. [المرجع المتقاطع]

30. تشو، Z .؛ تشانغ، العاشر. وانغ، ج.؛ Zheng، H. مختبر علم الوراثة وعلم وظائف الأعضاء 2: رؤى ناشئة حول الوظائف المثيرة للجدل لهذا المستقبل الذي يشبه RIG-I. بيوميد الدقة. كثافة العمليات. 2014، 2014، 960190. [المرجع المتقاطع]

31. سانشيز ديفيد، RY؛ كومبريديت، C .؛ سيسميرو، O .؛ ديليس، MA؛ جاجلا، ب. كوبي، جي واي؛ مورا، م. جربوا جالا، م.؛ ديسبريس، ص. تانجى، ف؛ وآخرون. تحليل مقارن لتوقيعات الحمض النووي الريبي الفيروسي على مستقبلات مختلفة تشبه RIG-I. إليفي 2016، 5، e11275. [المرجع المتقاطع]

32. رين، إكس؛ لينهان، مم؛ إيواساكي، أ. بايل، AM RIG-I يميز بشكل انتقائي ضد 50 - RNA أحادي الفوسفات. مندوب الخلية. 2019، 26، 2019–2027.e2014. [المرجع المتقاطع]

33. لي، العاشر. ليو، سي إكس؛ شيويه، دبليو؛ تشانغ، Y.؛ جيانغ، س.؛ يين، مؤسسة قطر. وي، J.؛ ياو، آر دبليو؛ يانغ، ل.؛ قام تشين، إل.إل. بتنسيق تكوين circRNA الحيوي ووظيفته مع NF90/NF110 في العدوى الفيروسية. مول. خلية 2017، 67، 214-227.e217. [المرجع المتقاطع]

34. سايتو، ت.؛ أوين، مارك ألماني؛ جيانغ، ف؛ ماركوتريجيانو، J .؛ Gale، M.، Jr. المناعة الفطرية الناجمة عن التعرف على RIG-I المعتمد على التركيب لفيروس التهاب الكبد C RNA. طبيعة 2008، 454، 523-527. [المرجع المتقاطع]

35. شنيل، ج. لو، YM؛ ماركوتريجيانو، J .؛ Gale، M.، Jr. يحدد تكوين Uridine للجهاز poly-U / UC الخاص بـ HCV RNA عدم التعرف على الذات بواسطة RIG-I. باثوج بلوس. 2012, 8, هـ1002839. [المرجع المتقاطع]

36. بيسلي، أ.؛ جو، MH. لين، C.؛ وو، ب. أورمي جونسون، م.؛ والز، T.؛ هونج، س. Hur، S. الآلية الحركية لتمييز طول الرنا المزدوج الجديلة الفيروسي بواسطة خيوط MDA5. بروك. ناتل. أكاد. الخيال العلمي. الولايات المتحدة الأمريكية 2012، 109، E3340-E3349. [المرجع المتقاطع]

37. بيسلي، أ.؛ لين، C.؛ وو، ب. أورمي جونسون، م.؛ ليو، م. والز، T.؛ Hur، S. التجميع التعاوني والتفكيك الديناميكي لخيوط MDA5 للتعرف على الرنا المزدوج الجديلة الفيروسي. بروك. ناتل. أكاد. الخيال العلمي. الولايات المتحدة الأمريكية 2011، 108، 21010-21015. [المرجع المتقاطع]

38. بيبج، دا. هيلموث، JC. كوي، S.؛ كيرشوفر، أ. لامينس، ك. لامينس، أ. شميت، أ.؛ روثينفوسر، S .؛ Hopfner، KP يستشعر المجال التنظيمي لعائلة RIG-I ATPase LGP2 الحمض النووي الريبي (RNA) المزدوج الذين تقطعت بهم السبل. الدقة الأحماض النووية. 2009، 37، 2014-2025. [المرجع المتقاطع]

39. أوشيكاوا، إي؛ ليثير، م. ماليت، ه.؛ برونيل، J.؛ جيرليير، د.؛ كوزاك، س. التحليل الهيكلي لربط الرنا المزدوج الجديلة بمستقبلات التعرف على الأنماط المضادة للفيروسات LGP2 وMDA5. مول. خلية 2016، 62، 586-602. [المرجع المتقاطع]

40. لومير، بنسلفانيا؛ أندرسون، إي. لاري، J.؛ آلية كول، JL لتنشيط PKR بواسطة الرنا المزدوج الجديلة. جيه مول. بيول. 2008، 381، 351-360. [المرجع المتقاطع]

41. تشنغ، إكس؛ Bevilacqua، PC تنشيط البروتين كيناز PKR بواسطة RNAs المزدوج الذين تقطعت بهم السبل مع ذيول مفردة الذين تقطعت بهم السبل. الحمض النووي الريبي 2004، 10، 1934-1945. [CrossRef] [مجلات]

42. نلاجاتلا، ريال سعودي؛ هوانج، J.؛ توروني، ر. تشنغ، X.؛ كاميرون، CE؛ Bevilacqua، PC 50 - تنشيط PKR المعتمد على ثلاثي الفوسفات بواسطة RNAs مع حلقات جذعية قصيرة. العلوم 2007، 318، 1455-1458. [CrossRef] [مجلات]

43. كول، JL تفعيل PKR: قضية مفتوحة ومغلقة؟ اتجاهات الكيمياء الحيوية. الخيال العلمي. 2007، 32، 57-62. [CrossRef] [مجلات]

44. دونوفان، ج.؛ دوفنر، م. Korennykh، A. الأساس الهيكلي لمراقبة الحمض النووي الريبي النووي المزدوج تقطعت بهم السبل بواسطة إنزيم أوليجوادينيلات البشري 1. Proc. ناتل. أكاد. الخيال العلمي. الولايات المتحدة الأمريكية 2013، 110، 1652-1657. [المرجع المتقاطع]

45. إبسن، MS؛ جاد، سمو؛ ثافاتشيلفام، ك.؛ بويسن، T.؛ ديسبريس، ص. Hartmann, R. تعمل إنزيمات 20 -50 - oligoadenylate Synthetase 3 على تصنيع 20 -50 - oligoadenylates المطلوبة لتنشيط RNase L. جي فيرول. 2014، 88، 14222-14231. [المرجع المتقاطع]

46. ​​كول، أ. ديو، S.؛ بوي، إب؛ أوريس، جي إل؛ جينونج، م. McKenna، SA تأثير خصائص الحمض النووي الريبي (RNA) المزدوج تقطعت بهم السبل على تنشيط إنزيم أوليجوادينيلات 2 (OAS2) البشري 20 -50 -. الكيمياء الحيوية. خلية. بيول. 2020, 98, 70-82. [المرجع المتقاطع]

47. هوانغ، هـ؛ زكيراج، إي؛ دونغ، ب. جها، بك. دافي، نيو مكسيكو؛ أورليكي، S .؛ ثيفاكوماران، ن.؛ تالوكدار، م.؛ بيلون، MC. سيكاريلي، مدافع؛ وآخرون. يكشف الهيكل الثنائي لـ pseudokinase RNase L المرتبط بـ 2-5A عن أساس النشاط المضاد للفيروسات الناجم عن الإنترفيرون. مول. خلية 2014، 53، 221-234. [المرجع المتقاطع]

48. رجل، إس إم؛ كاركي، ر. Kanneganti، TD AIM2 inflammasome في العدوى والسرطان والمناعة الذاتية: دور في استشعار الحمض النووي والالتهابات والمناعة الفطرية. يورو. جي إمونول. 2016، 46، 269-280. [المرجع المتقاطع]

49. شياو، TS الجسيمات الالتهابية التي تستشعر الحمض النووي. إيمونول. القس 2015، 265، 103-111. [المرجع المتقاطع]

50. كومار، V. ثالوث cGAS، TLR9، وALRS حراس المجرة الخلوية ضد الحمض النووي الذاتي المشتق من المضيف. أمام. إيمونول. 2020، 11، 624597. [المرجع المتقاطع]

51. كروبينا، ك.؛ جوجيناشفيلي، أ. Cleveland، DW أسباب وعواقب النوى الصغيرة. العملة. رأي. خلية بيول. 2021, 70, 91-99. [المرجع المتقاطع]

52. بون، جا. داسيلفا، J .؛ خاريتونتشيك، S .؛ مرسيدس، م. فوسترز، ج.؛ تيليسنيتسكي، أ. هاتزيانو، ت.؛ سميث، جيه إل تعتبر المرونة في ربط الحمض النووي أمرًا أساسيًا لنشاط APOBEC3H المضاد للفيروسات. جي فيرول. 2019، 93، ه01275-19. [المرجع المتقاطع]

53. فولام، أ.؛ Schroder، M. DExD / H-box RNA طائرات الهليكوبتر كوسطاء للمناعة الفطرية المضادة للفيروسات والعوامل المضيفة الأساسية لتكاثر الفيروس. الكيمياء الحيوية. بيوفيس. اكتا 2013، 1829، 854–865. [المرجع المتقاطع]

54. كانتون، ج.؛ نيكولاي، د.؛ Grinstein، S. مستقبلات زبال في التوازن والمناعة. نات. القس إيمونول. 2013، 13، 621-634. [المرجع المتقاطع]

55. شويرك، J.؛ سوفيج، مهاجم. ريان، ا ف. توماس، KR. هاتفيلد، LD. أوزاركار، س. فوريرو، أ.؛ كيل، صباحا؛ روبي، جا؛ لذلك، ل. وآخرون. تتمتع الأشكال الإسوية للبروتين المرتبط بالحمض النووي الريبي (RNA) ZAP-S وZAP-L بوظائف متميزة مضادة للفيروسات والمناعة. نات. إيمونول. 2019، 20، 1610-1620. [المرجع المتقاطع]

56. هاياكاوا، س.؛ شيراتوري، س.؛ ياماتو، ه.؛ كامياما، T.؛ كيتاتسوجي، C .؛ كاشيجي، ف؛ اذهب الى س.؛ كاميوكا، س. فوجيكورا، د.؛ يامادا، ت.؛ وآخرون. ZAPS هو محفز قوي للإشارات بوساطة RNA helicase RIG-I أثناء الاستجابات المضادة للفيروسات. نات. إيمونول. 2011، 12، 37-44. [المرجع المتقاطع]